Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_egu_miR544
Species Elaeis guineensis
Class miRNA
Genome position Chr1:34652294-34652511 [+]
Reference genome EG5
Source SRR3042544
Length 25
Mature sequence(if miRNA) 1 - ACUUUCUGUGAAUAUAUAUGACGUC - 25
Stem-loop(if miRNA) --     C        U          C       CC  A    C  CC   CA           UUU   U  --A        A    CC    --A        -A  U
  ACUUU UGUGAAUA AUAUGACGUC UGAAUAA  UA AUGG UU  UAA  UCUUAUAUGAC   UUA GA   UAUAUAUG UAUU  GAAU   AUAUAUAU  AC U
  ||||| |||||||| |||||||||| |||||||  || |||| ||  |||  |||||||||||   ||| ||   |||||||| ||||  ||||   ||||||||  || U
  UGAAA ACACUUAU UAUACUGCAG GCUUAUU  AU UAUU AA  AUU  GGAAUAUACUG   AGU CU   GUAUAUAU AUAA  CUUG   UAUAUAUA  UG C
AC     A        U          A       AU  A    A  AA   AC           --U   C  ACG        A    AU    CAG        AG  U
Stem-loop sequence ACUUUCUGUGAAUAUAUAUGACGUCCUGAAUAACCUAAAUGGCUUCCUAACAUCUUAUAUGACUUUUUAUGAAUAUAUAUGAUAUUCCGAAUAAUAUAUAUAACUUUCUGUGAAUAUAUAUGACGUUCUAAAUAAUAUAUAUGGCAUCCUGAUGUCAUAUAAGGCAUUAAAAAAUUAUAUAUAUUAUUCGAGACGUCAUAUUUAUUCACAAAAAGUCA