Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_egu_miR478
Species Elaeis guineensis
Class miRNA
Genome position Chr5:27017577-27017679 [+]
Reference genome EG5
Source SRR3042542
Length 24
Mature sequence(if miRNA) 80 - AGAGAACAAUGAUACUGAGCAUGA - 103
Stem-loop(if miRNA) --    A   -      U      GG   A  ---A    GAGC  A      A
  AUGC CAG AUCAUU UUUUCU  UAG CG    GCUC    CU CAGUGU G
  |||| ||| |||||| ||||||  ||| ||    ||||    || ||||||
  UACG GUC UAGUAA AAGAGA  GUU GU    UGAG    GA GUCACA G
AG    A   A      C      UU   A  GGUG    -AAA  A      G
Stem-loop sequence AUGCACAGAUCAUUUUUUUCUGGUAGACGAGCUCGAGCCUACAGUGUAGGGACACUGAAGAAAGAGUGUGGUGAUUGUUAGAGAACAAUGAUACUGAGCAUGA