Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_egu_miR457
Species Elaeis guineensis
Class miRNA
Genome position Chr6:16858554-16858677 [-]
Reference genome EG5
Source SRR3042544
Length 24
Mature sequence(if miRNA) 101 - AUCAGGCAUGGAUGUAGAUGCACC - 124
Stem-loop(if miRNA) --     G     A  U  A   --     CAUUAU   CAA   ----     AA    UC    A
  AUCAG CAUGG UG AG UGC  ACCGU      GGC   CAA    AUGGG  GAUA  ACGA C
  ||||| ||||| || || |||  |||||      |||   |||    |||||  ||||  |||| C
  UAGUU GUACC AC UC ACG  UGGCA      CCG   GUU    UACCC  UUAU  UGUU A
CC     -     -  -  -   UC     -UUCCU   UUA   AUAC     CC    CU    U
Stem-loop sequence AUCAGGCAUGGAUGUAGAUGCACCGUCAUUAUGGCCAACAAAUGGGAAGAUAUCACGAACCAUUUGUUCUAUUCCCCCAUCAUAUUGAUUGCCUCCUUACGGUCUGCACUCACCAUGUUGAUCC