ncRNA ID | novel_egu_miR223 |
Species | Elaeis guineensis |
Class | miRNA |
Genome position | Chr6:24852508-24852662 [+] |
Reference genome | EG5 |
Source | SRR5189967 |
Length | 23 |
Mature sequence(if miRNA) | 1 - AGUAGACUCUGCGGAUAACGUGG - 23 |
Stem-loop(if miRNA) |
--   A  -C    C     -    --  UG ---      --A  -     -    AA    GUCCAA   AG    -   -   U   AGU GA  UCUG GGAUA ACGU  GG  A   UCCACU   AC AAAGC AGUU  GCCA      AAU  AAGC UCA CCU A   ||| ||  |||| ||||| ||||  ||  |   ||||||   || ||||| ||||  ||||      |||  |||| ||| |||   UCA CU  AGAU CCUGU UGUA  UU  U   AGGUGA   UG UUUCG UUAA  CGGU      UUA  UUCG AGU GGA A UG   A  AA    -     A    GA  GU AGA      ACC  A     A    -C    ----AA   GA    G   A   G |
Stem-loop sequence | AGUAGACUCUGCGGAUAACGUGGUGAUCCACUAACAAAGCAGUUAAGCCAGUCCAAAAUAGAAGCUCACCUUAAGAGGAUGAGGCUUAGAUUAAUGGCCAAUUAGCUUUAGUCCAAGUGGAAGAUUGUUAGAUGUAUGUCCUAGAAAUCAACUGU |