Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_egu_miR223
Species Elaeis guineensis
Class miRNA
Genome position Chr6:24852508-24852662 [+]
Reference genome EG5
Source SRR5189967
Length 23
Mature sequence(if miRNA) 1 - AGUAGACUCUGCGGAUAACGUGG - 23
Stem-loop(if miRNA) --   A  -C    C     -    --  UG ---      --A  -     -    AA    GUCCAA   AG    -   -   U
  AGU GA  UCUG GGAUA ACGU  GG  A   UCCACU   AC AAAGC AGUU  GCCA      AAU  AAGC UCA CCU A
  ||| ||  |||| ||||| ||||  ||  |   ||||||   || ||||| ||||  ||||      |||  |||| ||| |||
  UCA CU  AGAU CCUGU UGUA  UU  U   AGGUGA   UG UUUCG UUAA  CGGU      UUA  UUCG AGU GGA A
UG   A  AA    -     A    GA  GU AGA      ACC  A     A    -C    ----AA   GA    G   A   G
Stem-loop sequence AGUAGACUCUGCGGAUAACGUGGUGAUCCACUAACAAAGCAGUUAAGCCAGUCCAAAAUAGAAGCUCACCUUAAGAGGAUGAGGCUUAGAUUAAUGGCCAAUUAGCUUUAGUCCAAGUGGAAGAUUGUUAGAUGUAUGUCCUAGAAAUCAACUGU