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BaseInfo

ncRNA ID novel_cmo_miR165
Species Cucurbita moschata
Class miRNA
Genome position Cmo_Chr12:7553966-7554110 [+]
Reference genome Cmoschata_v1
Source SRR1632267
Length 23
Mature sequence(if miRNA) 1 - AUGACUAUGUGAUGUAUGGACUG - 23
Stem-loop(if miRNA) --AUG        -  G     AC       ACU  UGA         -     --A       --U  UG  GU
     ACUAUGUG AU UAUGG  UGUGUUG   GC   UUGUUUAUG CUAUG   AACGUAA   GG  AU  U
     |||||||| || |||||  |||||||   ||   ||||||||| |||||   |||||||   ||  ||  G
     UGAUGCAC UA GUACU  AUAUAAU   UG   AAUAAGUAU GAUGU   UUGUAUU   CU  UG  A
UAUUA        A  G     GU       GAU  UAG         U     GUA       UGU  GU  UC
Stem-loop sequence AUGACUAUGUGAUGUAUGGACUGUGUUGACUGCUGAUUGUUUAUGCUAUGAAACGUAAUGGUGAUGUUGACUGUUGUCUGUUUAUGUUAUGUGUAGUUAUGAAUAAGAUGUUAGUAAUAUAUGUCAUGGAUACACGUAGUAUUAU