ncRNA ID | novel_cmo_miR155 |
Species | Cucurbita moschata |
Class | miRNA |
Genome position | Cmo_Chr03:2604151-2604350 [-] |
Reference genome | Cmoschata_v1 |
Source | SRR1632266 |
Length | 24 |
Mature sequence(if miRNA) | 1 - AGAUGUCUGAGAUGUAUGAGAUGU - 24 |
Stem-loop(if miRNA) |
--    AAG      G        G        G       UG        G        G   AG   G        G        G   AG   G  A   AUUU   AUGUCU AGAUGUCU AGAUGUCU AGAUGUC  AGAUGUCU AGAUGUCU AGA  UCU AGACGUCU AGACGUCU AGA  UCU AG U   ||||   |||||| |||||||| |||||||| |||||||  |||||||| |||||||| |||  ||| |||||||| |||||||| |||  ||| ||   UAGA   UGUAGA UCUGUAGA UCUGUAGA UUUAUAG  UCUGUAGA UUUGCAGA UCU  AGA UCUGUAGA UCUGUAGA UCU  AGA UC G UG    GUA      G        G        A       CG        G        G   GA   G        G        G   GA   A  U |
Stem-loop sequence | AUUUAAGAUGUCUGAGAUGUCUGAGAUGUCUGAGAUGUCUGAGAUGUCUGAGAUGUCUGAGAAGUCUGAGACGUCUGAGACGUCUGAGAAGUCUGAGAUGUCUAAGAAGUCUGAGAUGUCUGAGAUGUCUGAGAAGUCUGAGACGUUUGAGAUGUCUGCGAUAUUUAAGAUGUCUGAGAUGUCUGAGAUGUAUGAGAUGU |