Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_cmo_miR155
Species Cucurbita moschata
Class miRNA
Genome position Cmo_Chr03:2604151-2604350 [-]
Reference genome Cmoschata_v1
Source SRR1632266
Length 24
Mature sequence(if miRNA) 1 - AGAUGUCUGAGAUGUAUGAGAUGU - 24
Stem-loop(if miRNA) --    AAG      G        G        G       UG        G        G   AG   G        G        G   AG   G  A
  AUUU   AUGUCU AGAUGUCU AGAUGUCU AGAUGUC  AGAUGUCU AGAUGUCU AGA  UCU AGACGUCU AGACGUCU AGA  UCU AG U
  ||||   |||||| |||||||| |||||||| |||||||  |||||||| |||||||| |||  ||| |||||||| |||||||| |||  ||| ||
  UAGA   UGUAGA UCUGUAGA UCUGUAGA UUUAUAG  UCUGUAGA UUUGCAGA UCU  AGA UCUGUAGA UCUGUAGA UCU  AGA UC G
UG    GUA      G        G        A       CG        G        G   GA   G        G        G   GA   A  U
Stem-loop sequence AUUUAAGAUGUCUGAGAUGUCUGAGAUGUCUGAGAUGUCUGAGAUGUCUGAGAUGUCUGAGAAGUCUGAGACGUCUGAGACGUCUGAGAAGUCUGAGAUGUCUAAGAAGUCUGAGAUGUCUGAGAUGUCUGAGAAGUCUGAGACGUUUGAGAUGUCUGCGAUAUUUAAGAUGUCUGAGAUGUCUGAGAUGUAUGAGAUGU