ncRNA ID | novel_bra_miR1012 |
Species | Brassica rapa |
Class | miRNA |
Genome position | ChrA9:8997741-8997840 [-] |
Reference genome | Brapa_1.0 |
Source | SRR1485284 |
Length | 24 |
Mature sequence(if miRNA) | 77 - AGCUAUGUGGAUCUCAGACCUCCA - 100 |
Stem-loop(if miRNA) |
--A      -        A  C   CAA     --AUC   CA    -   G    GCUAUG UGGAUCUC GA CUC   AUGUU     UGA  GCUC AAC C    |||||| |||||||| || |||   |||||     |||  |||| |||    UGAUGC AUCUAGAG CU GAG   UACAG     ACU  CGAG UUG U UUG      U        A  C   ACG     CAACA   AA    A   C |
Stem-loop sequence | AGCUAUGUGGAUCUCAGACCUCCAAAUGUUAUCUGACAGCUCAACGCUCGUUAGAGCAAUCAACAACGACAUGCAGAGCUCAGAGAUCUAUCGUAGUGUU |