Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_bra_miR1007
Species Brassica rapa
Class miRNA
Genome position ChrA4:7089357-7089443 [+]
Reference genome Brapa_1.0
Source SRR1485283
Length 21
Mature sequence(if miRNA) 1 - AAGCGCUAGAUCUAGGAUUUC - 21
Stem-loop(if miRNA) --   -  CU  A         -UCU         A  AAG   A
  AAG CG  AG UCUAGGAUU    AUUCAAGUA UC   AUU U
  ||| ||  || |||||||||    ||||||||| ||   ||| A
  UUC GC  UC AGAUCCUAA    UGGGUUCAU AG   UGG A
UU   A  --  A         CUGU         A  AUA   A
Stem-loop sequence AAGCGCUAGAUCUAGGAUUUCUAUUCAAGUAAUCAAGAUUAUAAAGGUAUAGAAUACUUGGGUUGUCAAUCCUAGAACUCGACUUUU