Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_bra_miR816
Species Brassica rapa
Class miRNA
Genome position ChrA2:9952440-9952536 [-]
Reference genome Brapa_1.0
Source SRR1485262
Length 24
Mature sequence(if miRNA) 74 - AUAUUGUAGAUUUGGGAUUUUGAU - 97
Stem-loop(if miRNA) --     G  --    UG         UUU   A   G  AUAA     
  AUAUU UA  GAUU  GGAUUUUGA   AGA AUU GU    CAAGAU
  ||||| ||  ||||  |||||||||   ||| ||| ||    |||||U
  UAUAG AU  CUAG  UUUAAGAUU   UUU UAA UA    GUUUUA
UA     G  AA    UU         UUU   A   G  GAAA     
Stem-loop sequence AUAUUGUAGAUUUGGGAUUUUGAUUUAGAAAUUGGUAUAACAAGAUUAUUUUGAAAGAUGAAUAUUUUUUUUAGAAUUUUUGAUCAAUAGGAUAUAU