ncRNA ID | novel_bra_miR816 |
Species | Brassica rapa |
Class | miRNA |
Genome position | ChrA2:9952440-9952536 [-] |
Reference genome | Brapa_1.0 |
Source | SRR1485262 |
Length | 24 |
Mature sequence(if miRNA) | 74 - AUAUUGUAGAUUUGGGAUUUUGAU - 97 |
Stem-loop(if miRNA) |
--     G  --    UG         UUU   A   G  AUAA        AUAUU UA  GAUU  GGAUUUUGA   AGA AUU GU    CAAGAU   ||||| ||  ||||  |||||||||   ||| ||| ||    |||||U   UAUAG AU  CUAG  UUUAAGAUU   UUU UAA UA    GUUUUA UA     G  AA    UU         UUU   A   G  GAAA      |
Stem-loop sequence | AUAUUGUAGAUUUGGGAUUUUGAUUUAGAAAUUGGUAUAACAAGAUUAUUUUGAAAGAUGAAUAUUUUUUUUAGAAUUUUUGAUCAAUAGGAUAUAU |