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BaseInfo

ncRNA ID novel_bra_miR276
Species Brassica rapa
Class miRNA
Genome position ChrA5:11619446-11619561 [-]
Reference genome Brapa_1.0
Source SRR1592476
Length 21
Mature sequence(if miRNA) 1 - AGAGCUAGUUGCGUUGGAUUG - 21
Stem-loop(if miRNA) --                  C      C              U    -   CUCCA   GA
  AUCCAACGCAACUAGCUC CGAUCU UGAUAAGACAGCUC GAUC GAG     AUG  U
  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||     |||  A
  UAGGUUGCGUUGAUCGAG GCUAGA GCUAUUCUGUCGAG CUAG CUC     UAC  A
GU                  A      U              -    U   -----   AG
Stem-loop sequence AUCCAACGCAACUAGCUCCCGAUCUCUGAUAAGACAGCUCUGAUCGAGCUCCAAUGGAUAAGACAUCUCUGAUCGAGCUGUCUUAUCGUAGAUCGAGAGCUAGUUGCGUUGGAUUG