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BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_000895
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position 1:2802386-2803616[+]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method NA
Type exonic
Splice junction sequence AGGTAGATTATCGTGGATATGAGGTAACAGTTGAAAATTTCTTACGGGTTTTGACTGGGCGTCATGAGAATGCTGTTCCAAGGTCAAAGCGTCTCCTCAGCTCCCCTTGCTGCTGTGCAGTTTATTTAGGTCCTACGATCCGAGACTGCTAATGTCTACTGCCTACTACCGGACTGATCTTTACCAACCACATCTGGTGG
Tissues aerial
Exon boundary No-No
Splicing signals TC-AG
circRNA sequence NA
Genomic sequence AGGTAGATTATCGTGGATATGAGGTAACAGTTGAAAATTTCTTACGGGTTTTGACTGGGCGTCATGAGAATGCTGTTCCAAGGTCAAAGCGTCTCCTCAGTGATGAGGGTAGCCATATACTACTGTACATGACTGGGCATGGAGGTGATGAATTTTTGAAGTTTCAAGATGCAGAAGAACTCCAGAGTCACGATTTAGCAGATGCTGTAAAACAAATGAAAGAGAAGCGTAGGTTTGTTTCACATTTATGGTGTTTCTCGAGTCATATTGACTCCATTTCCTCCATTAGTTCAGTGCTTTTTATCTGTCTTTTGAAATCTGGCTTGTCCTGCATATAGCTTTTCCACAGGGCATTTCTTGGTGGAACGAAAATTATTCATTCAATGTCTCATCTTAATTCAATTTTGACTATCTAATGACATTATTTCGCTTGCCTAGATTCAAGGAGCTGATGATAATGGTTGATACTTGCCAAGCTGCCACTCTCTTTAATCAGGTACATCTTCGCACACTTTTTCAGGGTTGTTTTGTCTTTATATTTAAGTAAGCCATAATTTTAGTTTTGCTCTGCCTTTTGGAGCTAGTATGTTAATTTGACGTTGTTAGTTTTGTGAAATAATTTTTTTGGTAGCTTCAATCTCCTGGTGTTTTGGCTATTGGTAGCAGTCTAAAAGGAGAGAACTCATATTCCCATCACCTGGATTCAGATGTAAGTTCCCTTCACCATTTCATGAATGGAAAGTACCATTACGATATTAAGGGGAAAATTATTCAATGAAGTTGTCATTGTTTGGGGATTGTTTCTTCTTTTTATCATTGTATTGATCTCCAAATCTAATGTTGTTTTTGCTTCAGATTGGTGTATCTGTTGTAGATCGGTTTACATATTACACTCTTGCATTCTTTGAGAGGCTCAATATATATGACAATGCATCACTTAACAGGTACAATAACTATGCAACTCTCGTCACCAACATTCTGCAAACCTTTTATATGATATTCGTTTTCACTTTGATTATATATGACGGCATTGTGATTGTCAAATTGACTAAGGAGACGATTAAATAGTTGGCTGTTTGAACTAATACGCCTTTTTAGCCTGAACTATCTGAGCTAGAAACATTTGTTCACCTCCCCTTGCTGCTGTGCAGTTTATTTAGGTCCTACGATCCGAGACTGCTAATGTCTACTGCCTACTACCGGACTGATCTTTACCAACCACATCTGGTGG