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BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_000844
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position 1:2646891-2647900[+]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method NA
Type exonic
Splice junction sequence ACCTCCGTGGACACCTGAAATGTCAGTGGAAGAACTTGATGCTAATGAAAAACAAGCTTTTCTAAATTGGCGCCGGATGCTTGTGAGGTTAGCTTTTTTTGAAGATTCATCGTGACACAGGCATATGCTCAAGAAATTGATGAGCATAAAAAAATAATGCTTCTAGTGAACAAGGCGGATCTTTTACCTACTGATGTCAG
Tissues whole_plant
Exon boundary Yes-Yes
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence ACCTCCGTGGACACCTGAAATGTCAGTGGAAGAACTTGATGCTAATGAAAAACAAGCTTTTCTAAATTGGCGCCGGATGCTTGTGAGGTTAGCTTTTTTTGTTCTACCCCATCTTAATTTTACTTCTTCGGTGTGTTATAAACAAATCAATATCTGTCACCAAATTGTTTGTTGGTGATGATAAAATTTAGGCAGCTTCTGTCACATAGTTTTGTTCAAATGGTAAAAGCTGATGCTGTAGTTGATAAAATGCATGTATTTTGAGCAAATATTCTACCTTTGTATCGTACTGAGAAGGTCGAAATGGGATAAGCTGAGAAGATCTCATTCTTGTATCCATTTCCCAGTTTTGTTGTGGAAACTGAAAATCTCAGTTTTGTTGTTATTGGTATAATGTGCTGTGTATAAGTTTATCTCATGTAGGATAGTGTTTGCTAAAGCCGGAACTTTTATAGAATCGAGTTGTGTTCAAGATATCTTTCGTATATAAACCAAACTAGAGTTTATAGATGTTTGACCCTAATCAATCTTTTGGATTGGGAAGTTTATAGGTGTTACGCATGCTTACATGTTCTCCTGTATTTTGGTTTAGCCTTGAGGAAAATGAAAAGCTAGTGTTGACTCCATTCGAAAAGAACCTTGACATCTGGAGACAGCTTTGGAGAGTGCTTGAACGCAGTGATTTGGTAAGTCTTTGTCAATAATGTATTAACCTTCTCAATAAGTTCAATTTCTGCGTTTTAGTTAATTGCAAAACAGTTTTGATTACTTATACTTGTCCTTTTTTCAGATTGTTATGGTAGTTGATGCTAGAGATCCACTGTTTTACCGCTGCCCTGATCTTGAGGTAATGCATTTTCTCCCAGCTTGAAACTCCACTTGGCACCGTATTCCTGATTCATATTTACTTGAAGATTCATCGTGACACAGGCATATGCTCAAGAAATTGATGAGCATAAAAAAATAATGCTTCTAGTGAACAAGGCGGATCTTTTACCTACTGATGTCAG