Search result

BaseInfo

ncRNA ID ath_circ_000429
Species Arabidopsis thaliana
Class circRNA
Genome position 1:1352638-1353799[+]
Reference genome TAIR10
Source PlantcircBase
Method NA
Type exonic
Splice junction sequence ATCGGACCTGCTGATCCTGAAGACAATCAAACAATCTGTTGAGATGCGGAACAGTGTATGTCACAGTGCTACAATTTATGCTAATGCTATAATGCATGCTCCGCCAACTTCTTCACTTTGCTGTGTCTGATGTCAGTGACGATGTTAGGAGGACTGCTGTTCTTGCACTTGGATTTGTCTTATACTCTGATCCAGAGCAG
Tissues whole_plant
Exon boundary Yes-Yes
Splicing signals AG-GT
circRNA sequence NA
Genomic sequence ATCGGACCTGCTGATCCTGAAGACAATCAAACAATCTGTTGAGATGCGGAACAGTGTATGTCACAGTGCTACAATTTATGCTAATGCTATAATGCATGCTGGAACGACAGTTGACACTTTTCTCAGGGAGAATTTGGTAAAATTTATTTTCTCTACCACTTTTTAACTTGTTTCAACGTCAACTATGTGGCATATTATTTAATCTTCTTTTCTTTTCCATTCATGTTTGAATTGTCAGGATTGGCTAAGCAGGGCCACCAATTGGGCCAAGTTTAGTGCTACAGCAGGATTAGGTGTTATTCATAGGGGTCACTTGCAACAGGGCAGGTCACTGATGGCCCCATACTTGCCTCAGGGCGGAGCAGGTGGTGGCGGGAGTCCTTATTCCGAAGGGGGTGCTTTATATGCTCTCGGCCTTATTCATGCAAACCATGGTGAGGGAATCAAGCAATTTCTTCGTGATAGTCTACGCAGCACTAGTGTTGAGGTGATTTGCTATATCTTTCTTCTGGATAGTCTTCCGTTATATCACCAAAAAGATAGTCTTTTGTTTAGAATGATTTTCATTAAAAAAATATGGTTGCAGGTTATTCAACACGGAGCTTGTTTAGGTCTTGGTTTGGCTGCTCTTGGGACAGCTGATGAAGACATATATGATGATATCAAAAGTGTGCTTTACACTGACAGTGCTGTTGCTGGTGAAGCTGCCGGCATAAGCATGGGTCTATTGTTGGTTGGAACAGCAACTGATAAGGCAAGTGAGATGCTCGCTTATGCTCACGAGACTCAGCATGAGAAGATAATAAGGTAACTAAAGTCTGGAATATATTTTTGGCTATGTGTGTGGGTGCATGGTAATTTATTTCAATGTTTTAAGTAACCAACATCTGGTTTTGTGTTTAGGGGATTGGCTCTAGGAATAGCTCTCACAGTATATGGAAGAGAAGAGGGAGCAGATACTTTGATTGAGCAGATGACTAGAGATCAGGATCCTATCATCCGTTATGGTGGAATGTATGCACTCGCATTGGCTTACAGTGGAACTGCAAACAACAAAGCCATCCGCCAACTTCTTCACTTTGCTGTGTCTGATGTCAGTGACGATGTTAGGAGGACTGCTGTTCTTGCACTTGGATTTGTCTTATACTCTGATCCAGAGCAG