ncRNA ID |
ath_circ_000173 |
Species |
Arabidopsis thaliana |
Class |
circRNA |
Genome position |
1:528010-533716[+/+] |
Reference genome |
TAIR10 |
Source |
PlantcircBase
|
Method |
NA |
Type |
exonic |
Splice junction sequence |
ACTGTTGCTCTGGTAGGAGAAAGCGGGTCGGGGAAATCAACGGTGATCTCGCTGTTACAAAGATTTTACGATCCAGATTCCGGTCATATAACTTTAGATGTAAGGGAGATATTGAGCTTCGTCACTTAAGCTTCACTTATCCAGCAAGACCAGGCATTCAGATCTTTCGTGATCTTTGCTTAACCATTCGCGCAGGAAAG |
Tissues |
root, inflorescences, whole_plant |
Exon boundary |
Yes-Yes |
Splicing signals |
AG-GT |
circRNA sequence |
NA |
Genomic sequence |
ACTGTTGCTCTGGTAGGAGAAAGCGGGTCGGGGAAATCAACGGTGATCTCGCTGTTACAAAGATTTTACGATCCAGATTCCGGTCATATAACTTTAGATGGAGTTGAGCTCAAGAAGCTGCAGTTGAAATGGTTGAGACAACAAATGGGACTAGTGGGACAAGAACCTGTCTTGTTCAACGACACGATTCGAGCCAACATTGCTTATGGCAAAGGAAGCGAAGAGGCCGCTACCGAGTCTGAAATCATAGCCGCTGCAGAACTTGCCAATGCACACAAATTCATCTCTAGCATACAACAGGTAATGGAAAAAAAAAACAGAACAAATTTGTAAGAACTGTGTTTTTCAAAGTTTCTTACAATGCAAGCAATACAATTTTTAGGGTTATGACACAGTGGTGGGAGAGAGAGGGATCCAGTTATCCGGAGGACAGAAACAGCGGGTGGCTATAGCACGAGCCATCGTGAAAGAGCCGAAGATATTGCTTTTGGACGAAGCAACAAGCGCTCTTGATGCGGAATCAGAGCGAGTGGTTCAGGATGCGCTTGACAGAGTGATGGTAAACCGAACCACGATAGTGGTGGCTCACCGGTTATCTACCATTAAAAACGCTGACGTCATTGCCGTAGTTAAGAACGGTGTGATCGCTGAGAAAGGGACTCACGAGACGTTGATCAAAATCGAAGGTGGGGTTTATGCTTCGCTTGTTCAGCTTCACATGACTGCTTCTAATTGATGTGATATATAGTTTTGGTTTTATGAAAAGCTAAAACTTCAGTTTTGGCTTGAGTCAAAAACTAGCCAATGTACTAAAGGTTTTGTATTTATTTTTTTGTTGTTGTTTGTATACAAGTTAACGAAGCTGATATATATATCTTGTCTTTCAAGAAAGTATGCATACCTGTTTCTTGAATATCTTTGTTGACTTTTGTGCTTAGTCAACTTCCGGTTAAATGAAAATCCTCTCAGACTGTTAATTTGTGTAAATTATCTACGGAATTGTCTTCATGTACCATTTAATATTGTCTGTTCTATACTTGTTTCCTTTTTAAAATTTTTTATGATTGGGGTTTGTGTTTTAATTTGATCTCTGATTATACGAGTAACCCAAAGCCCAAAAGCATTTAAGCATGGGGACTCCTTTTCCCTTTAATTAACATTATCTGTTTCATCCGATTACTATTATAAATCACAATTTACTTCTTTAATAACTACAACAACTCTTGTCTCTCCATCTGTCAGTTTTAAATTCTCCTTCTTTCTCTTAACTAATTATGTTTACGTCTTTACGATTAATTAAAAGTGTATAAAAAAAAGAATCTTATTCATTGCCGAGCAACTACAAATCAAAGTGTAAAACTATAAAACTTTGTTACTAATATAAAATTGACTTACAAATCAAAGTGTAAAACTATACAACTTTGTAACTAATATAAATTTGACTAATTTCATTTTTGTTTAATCTTATTTTATTTTCACTAAATCTTTATACTTAACTACTAATCTAATATTACATATTAGTATTTTAATTAATATGGTGATAATTTCTGTGAACTCTCAGGTAAAATTTAATAGAAATCACAAGTGGGGGGTTTTGGGATTTATATCAGTAAAACTCTCAACTACGACTGGTCTGAAATGTTTCCTTAAATTCTTTAATGTTCTCGACCTTTTCTGGGTTTTAGGAAAAAGTTAAAAAAAAGCTCTCTTTTTGTCTGGGTTTTAGGAAGAAGAAAGCTCCTAACTTTATCATTATATACCGTCGAGTTCGATCTGAGAATGATCAGATTTCTTAAAATCCTTCTGATTTGTGTCAGCGCCGGAAAATGAACCGTGACGGCGCCGGAGAAGGCGACTCTGTTTCACACGAACATTCAACATCTAAAACCGATGAAAAGGCCAAGACAGTTCCTCTCTACAAGCTATTTGCGTTTGCAGATTCCTTCGATGTGTTTTTGATGATATGTGGCTCACTTGGAGCTATTGGGAATGGAGTGTGTTTACCTCTTATGACATTGTTGTTTGGTGATCTCATCGATTCCTTTGGAAAAAATCAGAACAACAAAGACATTGTTGATGTTGTCTCAAAGGTAAAAATCCAAACTTTTTTTGAACTTTTTGATTGTGTTCTTAGATCACATTTTAGTACTAATACTGTGTCTTCTTATATAGGTTTGTCTTAAATTCGTCTACCTTGGACTTGGAAGACTTGGAGCAGCCTTTCTTCGTAAGTCATTACCCGCGATTTGCTTGTTTCTCTGTTGCAATTGCATCTAAGGATTAGAGAATTGAGGAAGAAAAGTTTTGTTCTTTTGGTTTCTCCATTGCATTTTGCTTAAGGGTTAGAGAATTGAGGATGTGATGTTTTGGTATTTTTGTTCTTGTTGTTGTAGAGGTTGCTTGTTGGATGATTACTGGAGAGAGACAAGCCGCAAAGATAAGAAGTAACTATCTGAAAACAATTCTGAGACAAGACATCGGATTCTTCGATGTTGAAACAAACACAGGAGAGGTTGTTGGTAGAATGTCTGGAGATACTGTTCATATTCAAGATGCCATGGGTGAGAAGGTAATGCAGCTAACAGAGAAACTTCCGTATTGCGATTTCAGGCTTAGATATAATGATTGGATTCGTTTTTGAAGTTTGTTACACTTTTCTTGAATGTTGCAGGTGGGGAAGTTTATTCAGCTGGTATCTACTTTCGTTGGCGGATTTGCTTTAGCTTTTGCTAAAGGATGGTTGCTAACATTGGTTATGTTAACTTCGATTCCTTTTCTGGCTATGGCTGGTGCAGCCATGGCGCTTTTAGTGACTCGAGCTTCTTCTCGGGGACAAGCCGCTTATGCAAAAGCAGCAACTGTTGTTGAACAGACAATCGGGTCTATCCGAACGGTAAAAATCAGTCTTTCTAAGCTACAGAACAAATCTTTAAGTAAGATTAGTTGCTAAATTCCATTTTTTTTTAAAAGGTTGCTTCTTTTACGGGAGAGAAGCAAGCAATAAACAGCTACAAGAAGTACATAACATCGGCTTATAAATCAAGCATTCAACAAGGTTTCTCCACTGGTTTAGGACTTGGAGTAATGATCTATGTGTTCTTCAGCAGCTATGCTTTGGCTATTTGGTTTGGTGGGAAGATGATACTCGAAAAAGGGTATACCGGTGGCTCTGTGATCAACGTGATCATCATTGTGGTTGCGGGTTCAATGTAAATGCCTAGATCATTGGTTCTATATATACATCAGATTATGTCTTCTTCTTTGTTTATAAATGTGAGATTCCTAAGAGTTGTGTTCTGTTTTGTTTTTCTTTAGGTCGCTTGGGCAAACATCTCCATGTGTAACCGCATTTGCAGCAGGTCAAGCTGCAGCATATAAGATGTTTGAGACGATCAAAAGAAAGCCTTTGATTGATGCTTATGACGTAAATGGAAAGGTTCTTGGAGATATCCGAGGAGACATTGAACTGAAAGATGTGCATTTCAGTTACCCCGCGAGGCCAGACGAGGAGATATTTGATGGATTCTCTCTGTTTATCCCGAGCGGTGCAACAGCAGCACTGGTAGGAGAAAGTGGAAGTGGAAAATCTACGGTGATAAATTTGATTGAGAGGTTTTATGATCCGAAAGCCGGTGAAGTACTCATTGATGGAATTAATCTTAAGGAGTTTCAGTTGAAATGGATCAGAAGCAAAATCGGATTGGTCTGCCAAGAACCTGTTCTGTTTTCGTCGAGCATCATGGAGAATATCGCCTACGGGAAAGAAAATGCAACGCTTCAAGAGATTAAAGTAGCAACAGAGCTAGCAAATGCAGCAAAGTTCATAAATAACTTACCTCAGGGGTTAGATACAAAGGTAGGAGAGCACGGGACACAGCTCTCGGGAGGACAGAAACAGAGGATAGCTATTGCAAGAGCTATTCTTAAAGATCCGCGGGTTTTGCTTCTGGATGAAGCAACAAGCGCGCTCGATACAGAATCCGAAAGAGTGGTTCAAGAGGCTTTAGATAGAGTCATGGTTAACCGGACTACGGTGGTGGTTGCGCATAGATTAAGCACGGTAAGAAATGCGGATATGATTGCAGTAATTCACAGCGGAAAAATGGTGGAAAAAGGTTCGCATTCTGAGTTGTTGAAAGATTCCGTGGGAGCTTATTCGCAGCTCATTCGGTGTCAAGAGATAAACAAGGGTCATGATGCAAAACCATCAGACATGGCTTCGGGATCATCTTTCCGGAATTCGAATTTGAACATATCAAGAGAGGGATCGGTTATCAGTGGTGGAACCTCGTCTTTTGGAAATAGCAGTCGTCATCATTCTTTGAATGTCCTTGGTTTATTCGCTGGACTAGACCTTGGTAGCGGTAGCCAAAGAGTAGGCCAAGAGGAAACTGGAACGACGAGTCAAGAACCGCTCCGAAAAGTATCACTCACCCGAATCGCAGCTCTAAACAAACCTGAGATCCCGGTTCTCCTTCTTGGAACTGTAGTAGCAGCAATCAATGGCGCGATTTTCCCGCTTTTCGGGATTCTGATTTCAAGAGTCATCGAAGCGTTCTTCAAACCAGCTGACCAATTAAAGAAAGATTCAAGATTCTGGGCGATTATATTTGTAGCTCTGGGAGTAACTTCGTTGATTGTCTCACCGTCTCAAATGTATCTGTTTGCAGTAGCTGGAGGAAAACTTATACGACGAATTCAGTCAATGTGCTTTGAGAAAGCGGTTCACATGGAGGTTAGCTGGTTCGATGAGCCAGAGAACTCGAGTGGTACAATGGGGGCAAGGCTCTCGACTGATGCAGCTTTGATTAGAGCTCTAGTAGGAGATGCATTGTCTTTAGCGGTTCAAAACGCTGCATCTGCTGCGTCTGGATTGATTATAGCGTTCACTGCGAGTTGGGAATTGGCGCTTATAATCTTAGTGATGCTTCCTCTTATTGGTATCAATGGCTTTCTTCAAGTCAAGTTTATGAAAGGATTCAGCGCCGACGCAAAGGTCT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