Search result

BaseInfo

ncRNA ID CNT0020174
Species Zea mays
Class lncRNA
Genome position 2:29347004-29353561[+]
Reference genome NA
Source CANTATAdb
CPC status noncoding
CPC score -1.28569
Max peptide length 72
Max expression 4.06
Potential function splicing regulation
lncRNA sequence TGGTGTGGGGAGCAGAAGGGTAGTTCAATTCGGGTATGGGCTTTACTCTGGCTTTTGATGGTGCTGTCGCGCAGGTTACAACGAGAGCAAGGCCATCCCTGATTCCCTGATGCCTTCTTCCTTGAGAAGGCCTCCGCGGAGGCGTTCATGGAGCGAGTCGAGTCGGTAGTGGGCGAGGTATTCAACATCGTCAGGCAGTGGCAAACTCAGCAGCAGAAGCAGGTCCAGGAGTTCCAGGCACTACACGACACACACTTGGCTCCAGATGAGCATTCATAGTATTTCGTCTTCCATGTCAATTAACCTATAAACTCTTTAATAATTGACGTCTCGATGATGTGTTATCATCCATGTTTAACTTAAATGTGTTCTAGTTCTGAAATACCAAAGTTTATAAAACAAAAGATATGCAACAAGGAATCAACATTGAACTGTAGGTGTATGTGTGATAGCCTACCAAGTGTAAAAGTAGATATGTTCCCTTGGTTAGGTGTAGCTAAACATATGGTGAAAATTGGCAGAAGGGAAATGGTCCTAACATTCATTTTTTGGAAGAACTATATGGTATAGACTACAGAGTTCAGATGCTCAAGGTAGACAGTGGCTGTTTGGTTTGGAGGTATAACATAAATAAAATGTTCCATGTTATTATTGATAAATGCATTACATACAATAAAGAATACCATTGCATACTTTTTTTTTATTTCATTCTTTATTTTCTATAACCCTGGTTGTACCTCACATGCTACTGAATTCTCTTATATATATGATACATATAAGAGGAAGTATTTCAATGAGCCCAAAAGGCTAAGGAGAGAGCTGCAACTGAAGCTAGTGAAGATAAGGGGACAAGGTCTCTAAGGGAATCTTCAGCAACTACTCTAATGACTACACCAATGTCATCTCCCCCTACTATTCCCACACAGACAGAATAGTTCTAGAATTCTTGGTGGTAATAAAGAGTTGTTGCTGAAGTAAATGCAGTTCTTTCTGCAGCCAAAAAAACTTTAGTTGGCTTTCACATGATATGTGGCGATGAAAATATGTTTTCGTATGAATGGCATCGTGAGGAAGAACTTTTGCATCTAGAGTGTTTGGGTATATGTAATATGTTGTATGCCAAATGCAACTTCAAAAACCTTGGTAACAATATAGAATTAGTGTCTTGATTTATGCTATTTACTAATATTTTTAACTTAGAATGGGGAATTAATTGCAGAAGCTTCAGAGGAGATTTCTGAAAGAATGGTTTAATCTAGAAAATAATGAATTAATGTTCTTTTTGTATCAAATGCCATATGCAGAGGTATTGTTTCATTGAGGACTTCCATTCTTCTAGTGACAATATGTATGTGTACTGGATTGTGCAAGCAATTGCTGATTACTTTGATGTGTGGATTCATGCTTACACTTTGCATCATTCATGGTTCTGTCATATTGTCTCCCAAGTTGATTCCTATATGTCACTATGTAATGCATGATTTAATGTAGATGGCCACTAGTTATGTGTGCAAATTCTAGTTGATGAAGTGGCAATGTGTTCTCACTTATCAGTCCCTGATAAGCTAAAATTTCACCAAAACCTGGTCATATAGACCAAGTGCAGGTAACCATATCATAAAAAATGCAATTATATTATTTTTGTTGTCGTGTTATTGAAATGTTGGAAATATATTTTGGGCTAGAAGGAGGATGGCCAGACTATGTACTCTACTACTCTGCTTGGCCAGACTATGTACTCTACTACTCTGCTTCTTCCTTTTCAGTAAACTCCCTTTAGATACATATTTGAAAAAAATAAGCTTAGATTTTATTATGGCACTGGCATACATGGGCATGAGAAAAATTACGGTGTAAACATTTTTAACAAATCATTGAGTAATGTAGAAACAAGGACTTTGAGAATTCTGTATTTCTGTACTAGGAAACCATATGCTTAGGCAATTCTTCAGAGGCCATCTCTATCTGTTCATAGCCCTTGATAAACTTGCTATACCATTTAGCAGACAATTTTGGTGTTCGCTTTAGTGACTTGAAATTCACATGACAAAGACCATACTTTACGGTGTAACCAGAGATCCATTCGAAGTTATCCATCAAAGACCACACAAAATAACCTCTCACATCTGCTCCTTTCCTGCACAAAAGTAGCAAAGTTTTATTATTACCTGGCTGGAGAGCAGTTTACATGAAAAGATAATTGAGGCATGCAACAACCTTATTGCAAAGCTCAAGTAAGTGAGGTAGTCACGAATGTAAGTTGATCTTTCAATATCATTAATTATTTCTTCTGCTGTAGTGCTAATATTGGCTATTTGGGCATAACCTGAAAGATAAAAAAAGGGTGATCAAGAGATCCATACAGATATTTTTTATGGTACCAGTGTACTACAAGTGTAATATATGTAAATAAGCATGGAAGTGAATCATTGTTATGCACAAAGGCATATATTTTGTATCTAATTTGTAGATTTTAGGGAACCTAGTAACCCACCGTTCTCTGTGATGTACAAAGGTATGCTTTTATATCTCTGCTTTAAATACATGACCAACTTCTCCATGGAGCTTGGAACGACATAGGTGTTTGCAACAGGTGTCTGCAATATTAGTTTAGTTGTGTTAGCTTGTGCATAATTAATTTGTAACTAGGATTCTTGTTGAATAGAATAATGCAATATACAATGCCGATTTTTACCGGTTTTCCAATGGGTATCCCATTTCGTTCTGTTGATATAGAAACTAAAGCTTCAGAAGGGTAGGCGTCCATATCACATAGAGAATATATGCAATCCTTGACATAGAATGTTTGGTAGTGATTTACCCCGATGAAGTCAATTTGGTTCTTCAGTAGTTTCTTCTCTCCTTCTGTAAATTTTGGCAAGTTTGGACCTAAGATTTGGCGCATCTGGTGAGGATAGTCACCAAAGAACAAGGGATCCAAGATCCTGTTTTAGCATATATCATCAAGTGAGCATTCAATCGTGAAGATCAAAAGTTAGTTCCAATCGTAAAATGCTAGTATGATGGAAGGTTACTGAATCAATTGATACCATGGAGCATCGAAAGACAGAGCTCGGCTTACTGCCAAGTGGTCCTCTGTGATATTCCTTAGTGGTTCATACCATCTTAGATGTAATGAAATTCCTACAAAGCCACCTTGCTTGGACTGAGAAGGATGGGGAACAAGGAAAACAAATTATACAACTTTCATGAGTATTTAAGAGCAAGCACACGGGCTCAGTTGATGAATTCCCTGAATCACATTTCCCATATGGCTCGGAACAACGGTTGGGTGGAAATGCCCCAATGGAGTATGCAAGCTTTACAATAAGATTTGGCTCATTGAATGTGACCCAGTGCTTTACTCGGTCACCAAACATCTTGAAGCAAAGCTCAACGAAGTAGGTGAAGTCCTCCCTGAATAGAAATAAAGAAACAACCACATATGAACTTACGGCATCTTCGTAGATAAAGCTATAATATAGGTGACTAACTGAATTTGACTTACTGAATCTCTGGGTTCAACCAAGAATTGTATCTTTCTTGGAGTTCTTCAGGATGGCATTTGTGGAGGGAGGTAGCTGCCCGCATAATAGCAGAACAGAAGGCGTACCTTTTTCTAGCAGTCCGTTGATGAGGCTATTGTAGAATTTAACGCCTGCCTGATTAACACCTCCGAAGCGACCCTCTGGCCATGGATATTTGAAAGGTACAAGCATATAATTTAAGTTAAACACCGGCACTAAGGAAGGATCACGTGCGTGTTGTCGAGCTGGTAGCTGTGTCAGAAGTCATTGACAGTTGGTGTAATTCTGAGAATGAGCTCACTTGGAAGAATTCTCGACCACGACAATGAGAATCTGTAGGAGCTGAGACCAATCGAATGCATCATTTCTATGTCGTCCTGCCGGTGCTGACTTTGTGTGAGATTGTTGACCCCCTCATCTTTCTTGATAAAGTATCTTTTTGTTTCTAATGATGCTTACCTTGTATCGATGATAATGGTCAGCAGCTACGTCGCCATTGCTTCCATCGTCAATATTTCCTGATTTATGGTTAATAGCCAAGACTAAGACAGCAACAAAATCAAGCACGTCTGTGATTTTCACGATTTCAGCACTCCACAGGGGCAACCGGCCCTTCGTGACCTCGTCGTGCAGTCCTCGCTCCGGTAGCTCGAAGGAACGTCGCGATCCAACGCGCGGTGTCCTGGCGTCGTGAGCTTAGACGGGCCTAGTGCAAGCTGAGCGGCTGGATGTGCTGGACAGCGCTGTCGAGCGGCGAGAGCCGTCGAGTAGGCCGACTTCAGACGATCTGACGAATCCGAGCCGAAGAGTCATCCTAATCGGGCCCTCTATTTCCTAAGCCCGGCCCTCCCAGTTCTAGCTAGCTAAACAGAAGATGCATCATGCATTCACTAGCCAAAAAAAAAAATGTTCACTTCCTCCCCTGATTCAAGAGCGTGAAATGATTTTCTAACTGAGACAAAAAGAGAAAGAGGAAAGCGCAGTGCGCAATGACCTTCTAAATAGATACGTCTAATTAACATGCAAAATGTATGAGCGTCGAAATTAGGTTAAACCATTTAATTTATGACATCAAGAAGAGTGTTGAAAAATATTTAGTACAACATAATTGAAAGTACCAAGCAAAAAGAGAAGGAGATGGTATTGCCACCTGCTGATCCGGTCTGGCTAATTCCATATATATTGTCTAGAACTGGTTAGGATGGTTCATTAACCGGCCGAGCCGGTTTGCTTGCTGTGTCCGAAACTTATCGTGCTTAAATACGTTAAGCGACAAACAAACAACACAAATTATTAGTTGGATATGTAATCATGTCTAGATTATAATAATATATAAACAGATCATTAAGTGGTTATATAATTTATAAGTTGGATTATATAATCCTGAGAGGAAACAAACATAGCCTAAGTTGATTTATAAATTAGTATTGGATCTATTTTAGCGTGTAGGTCATATTTTGGACTTGGTTTTTACTATGATGATACCAACTCTTTCTATATGTGAGAGCATTATGGCTGATTAAGGATACCAAGCTTTCAATCGTCAGAAAATACATCATCTAATTTATTTACCATACTTTCTCTCTATCTTATTGTTCATCAGGAGATTTTATAGGTGACCTTAACAACCCTAGAGAAATCTTCGCGTACTATTCTCTGATAGATCTTTTCGAGAGGTGACTAAGAGTAGGGGGGCCTGGGTCGGGCGCGTATCCTCTAACATCGACTGCACTGACGTTGGGTCACTGCACGTGGCCCTAGGCCCACGCGTCAGTGACCCACCTTGACGTCAGAGGATCTCGACCCGTCTGGACCACCCGGGCCATGGCATTGGGACGTGACCCCAAATTTGTTAACTCCCACGAAAATATTAAAATATTATATGATTAATATTTGTTAAATGGTTTAAGTGTTTAATATATATATTTCATTCTTGTACTAGATTGTATCTCTAGACTTGAAATAATTGATGAAAAAGAACAAAGGTATTACTTTACAATGATGTTTTTTGTCATGTAACTTTTAAACTACTTGTTTTTGCCATGCTTTCATCAAAAATTGGTCCATATGGCTTTAGTCAATCTTGGTTCTGCCATTGCCGAGAGTTTACCGATAAACGAAAAACGGACTCAATATCAGCCTAACCAAGACCTCAATCTGTTTAGTTGATCCATTGCATTTTTGTTGCAATCAAGATTATTTACAACCACAGGCATACTAATTTTAACAAAAGCTACGAAAATATCCCAAGAATCCCCTTAACTATAAGGGCTAGTTGGAGAGCCATAAAACCGGAGTAGATTAGAGGGGCTAAAATTCCCTTCTTAGGGTTGATTTGGTGACAAGGAGATCACGAGGGGATTAAGGAGGAAATTAGATGGACTAATTTCCCCCTCAATACCCTCCAATCCCCCCGTGATTCCTGGTCACCAATAGGGCTAGTTGGCACCTCCATTTTCCTATGAGATTTCCAATTTTTCAAGGGAAAATGAACTAATTTCCCTGAAAAAAAATAAAAAACTCTTGGGAAAATAAGGTTCCCAAACTAGCCCTTATTTAAAATTGAATAAGGACGAGATTTTAGTTTTTCTAACCCTCTTCGGTTTTTGGACTCTCAAACTAGCCATAATAGTAGCTACTTCCACTAAGGTGGCCAAAGTTTGCTTGTACTCATTATTGAGTCGCTTAGATGGATTAGATCATCGTATGCATAACTGACACATTTGGAAGCACCTGGAACATGGGAGAAGACATCCCAATTGCTTAGGCCCTTGCTGTCGTCTAGGTATGCGCCTTCGACCTAAATTGAG