ncRNA ID | novel_bol_miR202 |
Species | Brassica oleracea |
Class | miRNA |
Genome position | ChrC8:3262252-3262458 [-] |
Reference genome | BOL |
Source | SRR961925 |
Length | 26 |
Mature sequence(if miRNA) | 1 - AGGAUUUAGGGUUUAGGGUUUAGAAU - 26 |
Stem-loop(if miRNA) |
--      G      G      A      G    GGGGUG  G      G      G      G  AAGGGG    G      A      G      G        UUUAGG UUUAGA UUUAGG UUUAGA UUUA      GA UUUAGG UUUAGG UUUAAA UU      UGGG UUUAGG UUUAGG UUUAGG UUUAGG   |||||| |||||| |||||| |||||| ||||      || |||||| |||||| |||||| ||      |||| |||||| |||||| |||||| |||||G   AGAUUU GGAUUU GGAUUU GGAUUU GGGU      UU AAAUUU GGAUUU GGAUUU AG      AUUU AGAUUU GGAUUU AGAUUU GGAUUU UA      G      G      A      G    GGGGAA  G      G      G      G  GUGGGG    G      A      G      G      |
Stem-loop sequence | UUUAGGGUUUAGAGUUUAGGAUUUAGAGUUUAGGGGUGGAGUUUAGGGUUUAGGGUUUAAAGUUAAGGGGUGGGGUUUAGGAUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGAGUUUAGGAUUUAGAGUUUAGGGGUGGAGUUUAGGGUUUAGGGUUUAAAGUUAAGGGGUGGGGUUUAGGAUUUAGGGUUUAGGGUUUAGAAU |