Search result

BaseInfo

ncRNA ID	CNT0017349
Species	Zea mays
Class	lncRNA
Genome position	10:3163433-3170769[-]
Reference genome	NA
Source	CANTATAdb
CPC status	noncoding
CPC score	-1.06447
Max peptide length	111
Max expression	71.616
Potential function	splicing regulation
lncRNA sequence	GCTCACCATCAGAGAGATTCAGGTCTAGAGAGGACAGGGAAGGCAGTGTTGTTCATCTGCTAGATTTTCTTCAACCACAGGCAACACATTTTCAGCTTAGATGAGGTTGTTGTCTTCCTCTAGTTCGCCGTCTTCCATGTCATTCTCATCCAATGCGACAACATCCTGGGTAGTGAATTGATGAAAATCTACTATCTTTCACTGGATGCGTTATTCACAAGCATATATTGAGTTCTCCTATGCCAGTCTCAATTCCTCTGCCAGCAATGTCTCCAGTAGGATGCAAATCTGTTTAAGTAATGGGTTGTTCAGAATATGGAGAAAATAAGTTATACTCATCGGTTCACAATTATAACACCATGTTCAATATATCATAATTCAGAGGATGCAGTGACACTCTTTGGGCTAGTTTGAAAGCAAGGGAATTAGAGGGGATTGAGGGTGCTCAAATTCCCTTCCTATTTAATTAGGAAGGGGATTTTAGCCATCTCTCCTCTAATTCTCTTGCTTCCGAACTAGTCCTTTATGTGTCCTTAAGAACAAGCCGATAGTATTTTTTTCAAACAAAAAGAGAACAAGCCGATAGTACCAACAATGTATAGCTAATATGAAACCATATACTAAACTCAAACTTCTCATCACCATATAATATATTTTCATATAAATTTATATTTTTGCAACACAGAATTTTTCAAAAGAAACAGAGAACTAAAATTCATGCAAGTGTTCAAAAATGGAATGAACATTAACAACAACTTATATAATATATATTTAATTTTAGGTTTCAGATGTATTAATATTCACTTATCAATTTGGTGATGAATCATCACCTATTCAGTATTCTAGATGAATTGAAAATTAAGATGTACGTAGTTCATGAAAAAAACAATAAATGTCATAACAAAGAAGATTAGGGTGTAGAGTGTATGTGTATCTACTGATGAATTTGGCATATAAGAACTTGGACTAGCAGGTTTCCGTCTAATTTGAATTTCCTTTGTTTCCTCTATAATACTGGATGCCTTATTATCCACAATTGTGAGCCCTTCCTGTCAAACAAAGGAAGCAAGTAATCATCAATTCACAATACAGTTCACGGTTATACCATTTATAGAAATAAAAACAAAATCAGATGTACAATGTTAAGTAAAAACACATTACTTCCAAAGCATTTTTTGGTCTTTCATCCACTCAACTGGTTGATATAATCAGAAAGAGCCGCAATGGTTTTCAAATGATCAAAGGAATGGCTTGTGGTGCTACATCTCCTGTCTTCCAGTGGTTTTCAAATGATTAACGATAGTTACATGACTGAAATTACAAAAAAAGTTGCAATAGCTGTAAATAGAATGCCTTGAACTATAAAACAGCAGAGAGAGGGAGACAATGCCATATACAAGAAGTCCATTAGTGACTGCCAATTTTTTCACATATTCAGATCCACTTACTGCCTCACCTGATATTTTCTAGATGCTCCAGGGTTGCTAAAAGGTTGTTCTTTCATTATGTACTCAAACTAAGGTGCCAAGCCAACGTCGTCAAGAATTCACTTGTCTTTACTTTCTAAAATTTTCCACATCCCATGCTTGTTCTCGTTTATTGCCTTGAACGCTGTGCAACATTACGATGAAGCATAGTCTTGTAAAAGAAAATCAGCATATCATCTCATAGTTGTGTGGGGGAAAAAAGTATTGTGACAGAAACAAGGTGATTTTGAAATGAGCATATGCATCATGGTTTATGAAATCTAATAATATGATAATGTGGAACCAAACAATCAGCAACCAAAAAGAACAAACTAAGTAAACTATAAGGACATTGTGTTTACTAGACCGTTGAAACTGGTGCTTTAAGTATATAGTATAGAAATAACACTCGCAGTGAATCAGGGAGTCCCTTGTTTGGTAGCGATCTGACGTTTTGAGTCCCAGTGATATGTATTTCCTAGAGAGAAGGAAGGCGATACAACCCTTGAGGGAGGGATTGTAGGGCCCTATAATGTTCGAACTGCAATTCTTGAAGAGACATGAGGAGCTGAAGCGCCATGTCCTTCTCTTCCATGAAGTTCTCTGTCCGCCAATCATGAAAGAAGATTAACATCTGGAGGTTGCGGAGAGGCATCTACAGATGGGAGCAACAGGCACCACGGTGATGCTGTCCACATAAAGTCTCACCAGTTGGAAGGAACTGATATGCATTGCTTTAGTCCTTGCCACATCTACAAGTAGATCTGCTGCAACATAATACAGCTCGGTCTCACCATGTCTCATATTGTACACCCTTAGATTCTTGAGGTTAAATGTGATGTGAGGATCGAATCCATCCATTGTGATATTTGTACAATCAAGTAACTCTAGACTAGTAAGAGATGTTAGATTCGTGAGCAGAGCCATCAGCCCAGTGCTTTGTTCATGGCAAAGACAATTATATATTTTGAGGCTCTTAAGAGATGTCAAATTCATGAGCAGAGCTTCCTGACGTAGAGTTCCCAGATAATGCTGTCAGCGAGCTAGAGGGTGGAAACTACAGTACCACTTCCTCATGGTCCTCATTTGATGATGTTGTCACATACAAAAAAGAAAGTGCTGGGAAACATTTGAACAAATTTGACAAAGAATTTTTGGTAGGCGTAAATCGTCCAAGTTTGAGAGATTGGACTGTGAGTAGCACAACACCATCATCCAGTCCTCTAAAAAATGTATCCTCGCATCTATTGACCTCTATATGTCTTAGGGAATGTAGATTTCAAAGATCATTAACCACCTGATTGGATGGCTGCGTCCATGCGCAGTCTGCCGTTGTCCTGACCAGCCATATATAACAATTTTGAGCGTATGCGTGAGTGCAGGTTAATAGCATCAAAATAGCTTATTTTGCATCCACTCATTACTACTATATACAAAGCAACTAAACATAATCTCAACTAGAGTTAATGCATGCAGTGATCTAAAATGAGATGATTCGGGTATCCAATCAGGTGGTAAATGAAAAGAGTGATGCATCCTGAGTTGTCAATCTCTTTAGGTCACCAAGATTTTGAAAGGCCAATACAGAGGGGTACTCAGTGTGCAAACTAGCACGATTATAATAAGACAAGGAGCCCATTTCAATACACGATATCGTCGGAGTGTCAAGCAATGGAGGAAGGCACAACTTCGGGCATCATGTAAAGATAACGAAGACTAGGGAACCATACGGCGTTATCTTCTATATGTGAAATAGACCAATCTGATATCATCAATCCCTAATCTCGGCGGATGGCTCCTTCCTTCCCCGCGCTCGCTCCCACGGCGACCGAGCTCCAAAACAACGCCGCCGCCAGATCCGCCCGCCACCGGCCGTCCTCAGCTCATGCCGGCTGCACCAAGCCAGATCCAACCCCGCACCCTCCTCCAGCACCACCAGCTCGCCCTCCTGTGTCCCAGCTCCCATCGCCACCGCCCCCACCACCACCGCCGGCCCGCCCTTCCGACCCAGCTCCATAATGCCACCCCCGCCCCGATAGCTGGTTTGAAGCCCCCCTGGAAGCTACGACCGCATTGAAGATGAGGATCTTGAAGGATGGACGACGATTCGGTGCAGGCGTGGACGCGTCACCCGCGTAGGCCTAGGCCGCGCCCCAGCGGCGCCTCGCCTGCTCTCAGCTCAAGCCCCTAGCCGTCTTATGGTAAGTCTACGTGCATATGAGATCACTAATTGAGCATATGTATCATGCTTTAGGGCATCTAGTATTATAAAGTGGAATCCAACAATGAGCAGCCAGCCATTCATGACTTGCCACAACAAGAACGAACTAAGGGGGTGTTTGAATGCACTAAAACTTAGTTAGCTAAAAATTGCTAGTGGAATTAGCTAGCTAACAAATAGCTACCTAACTATTAATTAATTTACCAAAAACACTTAATAGCTAAACTATTAGCTAGGTTGTTTGAATGTCTCAACTAATTTTAGTCACTAACTATTAGCTTTAGTGCATTCAAACACCCCTAAGTAATATAAGGACATGGTGTTTAATGAGACAATTTTCTTTTCTCCATAAAAGTATAAAAGTACCAATTCACGATATGAGATTGAAATAAAACTAAAGAACGGTGCAATAATGAGGTATTGTACTTCAAGAAGAAAAATGCTAGAAACATATTTTACCCAAAAGTTGAAATTGTAGAAGAAATTAAATTGGTTGATTAAACATTATGAAAATTACCTACTGAATTTTGTGCCAACCATGACCAACACATCATCCAATAAGACATCATCCTGGCTGTAGAATCGATGAAGATCAACTATCTCACGTATAGGAAGATGTTTTCACAGTATTTACCTAAACAGGAAAAACGCTAGAAAGTAAGATGACGATCCAAAAGTTGAAACTATAGTATGTAAGAGAAATTAAATTTCTTGGTTAAAGAAATGAATGGATGGACAGGAATTATGAATGGTGGCTCCAGTTGGCAGTTGTAATACAATAGCATCTGAGGATGGAACATATCGATATGCAAAAAATAAAAAAACAGTTCGGTTCGCAGTCAACGAAATCATAAATCACTCAACATAATGAGCTGTTTTTAGATATATTTGCAACTAACCTGTAGAGTGAAAGGCATGTTGAAGCAGAGCTGACTGTGAAGACATGCAGAAGCAGGTATTCAATTTTGCACACGAGCTTTGGAGGCAAGTACATTTATATCTGGCCTTGTTCCCTTCAATTGCTGGCATGCCTCATAAATCTCAGCACAACAGTTAGTTATACGTAGTATTCGTAGTGAATCGGGGAGGCCCTCCTTAGGCAGTGATCTAATGTTTTGAGGCCCATAGATAGTTATTCCGTGGAGAGAAGGAAGGCGGTGCAGTCCTTGGGGGAGGGACTGCAGAGCCCTGCAGTTATAAAACTCAAGGAATTGGAGAGACGTGAGGAGCTGAAGCGCCTCGTCCTGCTCTTTCGTGAAGTTCTCTGTCCGCCAATCATTACTGAAGTTTAACGTCTCGAGGGTAGCGGAGAGCAGCTTGCAGATGGGAGCAACAAGCACTCCCGAGATGTTGTCCACATAAAGTCCCACCAGTTTGAAGGAAACGTCGGGCATTGTTTTGGTCCTCACCACCGCTACAAGTAGATCTGCTGCTACAGAATACGGATCAGTTCCATCATTTCTCTCATTGTACACGCATAGATACTTGAGGCTGGATGTGATGTGAGGATTGAATCCATCCATTGTGATATTTCTGCAATTATATAAATATAGCGTGGTAAGAGATGTTAGATTCGCGAGTACAGCCATTCGCTCGGTGCTTTGCTCACAGCCAAGACAATTACATAGTGTGAGTTTCTCAAGAGATGTCAAATTCATGAGCAGAGCTTCCTGAGGCAGAGTTTCCATATAAGAAAGGAAGAGTTTCCTCAGGTAGGGTGGGAGAGGGTTGATGATGCTCTGAGTCTGAGTTGCTCGTCCTCCGATGGACCATCGAGAGAATAACCTGTCACATTTGTGTATGGTCACTGACTCGAGCGACGAGAGGCCACAGAATCCAGCTCCTTCCTCCATGGGTAGGATCAGATTCTTACACCCTGTGAAGTTGACATCTCTCAGCGAGCTAGAGGGTGGAAAATGCAGTACCACTTCCTCGTTGTCCTCATCTGATGGTGATGCCATCACATGCAAAGAAGAAAGTGCTGGAAAACATTTGAATAATTTTGACAAATAATTTTTGGTAGGTGTAAATCGTCCAAGGTAGAGAGATTGGACTGTGGGTAGCACAACACCATCATCCAGTCCTCTCAAAAATGTTTCCTCACATCTAGTGACATTTATACGTCTCAAGGAATGTAGCTTTTTAAGATCCATAAAGGACAAGGGTAGTGCATCCCAAGCTACCAATGTCTCTAGGTCACCCAGATTTTCGAAGGCAAATCTAGAGGGGTTATTAATTTTCAACATGGTACGACCTTCATAAGAAAAGTCTCCCATATGAATACGGGATACCTTTGAAGTGTGAGACACTTTTTTCTGTCGTGCTATCGAAGAAGCCAGGTCCAATCTGTGATATGCCAACAATTTTACTCAGCCTTAGCTCTCTTAAGTGATAGAACTGCCCAATAGGTGGAAGGTTAGCCCACGATACGCTCTCTAGATGTAGAGTCTCCAAGTTTTTCATGTATATGGTGTCGCTGCTGCACAACCAACTAGGACCGAGGGTACCACCATGATTTACAATAAAAAGACTCCTAACATTAGAGTGTGGTTGGATACTATCTAGGATATCATCTTCGGTGGACTCTTGTTTCATGTTCCAAATTAATCCCAACTCAACTAAATTCCTCTTTGACATCAGCTTGGCCTCTTTAGCTTCTTTCTTGGTTCTCACATTTTCAAGCCCGTATATATTGAGCTTCCCTCCAAGCTCATCTAGTTTACCCAATTCTTGTAGCTCAAATCCAACACTCTCTTTATTAACATGGAATTCTTTCAATTCTTGTAAGAAGATCATTTTCCCCACCTCAGGAACATTGGAATCAATCTTTTCCGAAACAACAAAATGGCATAGATTTTCAAGGCGGCTAATGTCCTTAGGCAAAGAACGATCACTTCCCCATTGTTCAAGATCTAGAAATTTCAGGTGATAAAACCTTGAGACCGTGTTTGGCAATGACATTTCTGAGTAATAAGGTGACAAAAGTTTTAAGTAGCGGAGATGAAGAAGCTCTGAAAAGTTGTTTGGCAAGGAACTATGGGAGTATATGAATATAGATAGAACACGAAGACGTCTTATTTCCTTAAATGTGTCCCTTAAAATATTGAGCAGATGTAACATAATGTATTTTCCAAATATCATCAAACTCCGCAAATTGTTAATGTATATCTTTTCTTTCAGTTTTCCCATTTGTTCCTCGAAATTCTGAGCACAATGATCTTGCATGGAAATGGATAGGTAACGGATAGACCGTGGGATGTTATTTGCCTCAAAACTAGAACAATCGATATAGGCACAATCTTCA