Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_bol_miR159
Species Brassica oleracea
Class miRNA
Genome position ChrC5:16648802-16648917 [+]
Reference genome BOL
Source SRR961925;SRR961924
Length 26
Mature sequence(if miRNA) 91 - UGGUUUAGGGUUUAGAGUUGAUGAUC - 116
Stem-loop(if miRNA) --GA  UG  GU      G        -     GU    G   U   G      G  GAU
    GU  AC  UUUAGG UUUAGAUU UGAAG  UUAG GUU AAG UUUAGA UU   G
    ||  ||  |||||| |||||||| |||||  |||| ||| ||| |||||| ||
    UA  UG  AGAUUU GGAUUUGG ACUUU  AGUU CGA UUU GGAUUU GG   U
CUAG  GU  --      G        U     GU    G   -   G      G  GCU
Stem-loop sequence GAGUUGACGUUUUAGGGUUUAGAUUUGAAGGUUUAGGGUUUAAGGUUUAGAGUUGAUGUUCGGGGUUUAGGGUUUAGCGUUGAUGUUUCAUGGUUUAGGGUUUAGAGUUGAUGAUC