ncRNA ID | novel_bol_miR159 |
Species | Brassica oleracea |
Class | miRNA |
Genome position | ChrC5:16648802-16648917 [+] |
Reference genome | BOL |
Source | SRR961925;SRR961924 |
Length | 26 |
Mature sequence(if miRNA) | 91 - UGGUUUAGGGUUUAGAGUUGAUGAUC - 116 |
Stem-loop(if miRNA) |
--GA  UG  GU      G        -     GU    G   U   G      G  GAU     GU  AC  UUUAGG UUUAGAUU UGAAG  UUAG GUU AAG UUUAGA UU   G     ||  ||  |||||| |||||||| |||||  |||| ||| ||| |||||| ||     UA  UG  AGAUUU GGAUUUGG ACUUU  AGUU CGA UUU GGAUUU GG   U CUAG  GU  --      G        U     GU    G   -   G      G  GCU |
Stem-loop sequence | GAGUUGACGUUUUAGGGUUUAGAUUUGAAGGUUUAGGGUUUAAGGUUUAGAGUUGAUGUUCGGGGUUUAGGGUUUAGCGUUGAUGUUUCAUGGUUUAGGGUUUAGAGUUGAUGAUC |