Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_bol_miR148
Species Brassica oleracea
Class miRNA
Genome position ChrC3:50146346-50146552 [+]
Reference genome BOL
Source SRR961924
Length 27
Mature sequence(if miRNA) 181 - UUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAUC - 207
Stem-loop(if miRNA) --    G      G      G      G      G      G      G      G      G      G      G      G      G      G     
  UAGG UUUAGG UUUAGG UUUAGG UUUAGG UUUAGG UUUAGG UUUAGG UUUAGG UUUAGG UUUAGG UUUAGG UUUAGG UUUAGG UUUAGG
  |||| |||||| |||||| |||||| |||||| |||||| |||||| |||||| |||||| |||||| |||||| |||||| |||||| |||||| |||||G
  AUUU GGAUUU GGAUUU GGAUUU GGAUUU GGAUUU GGAUUU GGAUUU GGAUUU GGAUUU GGAUUU GGAUUU GGAUUU GGAUUU GGAUUU
CU    G      G      G      G      G      G      G      G      G      G      G      G      G      G     
Stem-loop sequence UAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAUC