ncRNA ID | novel_bol_miR109 |
Species | Brassica oleracea |
Class | miRNA |
Genome position | ChrC3:41344933-41345094 [+] |
Reference genome | BOL |
Source | SRR961924;SRR961925 |
Length | 26 |
Mature sequence(if miRNA) | 137 - AGGGUUUAGAGUUUAGGGUUUAGGAC - 162 |
Stem-loop(if miRNA) |
--      G      G      G      G      G      G      G      G      G      G      G U   UUUAGG UUUAGG UUUAGA UUUAGG UUUAGG UUUAGA UUUAGG UUUAGG UUUAGA UUUAGG UUUAGG U U   |||||| |||||| |||||| |||||| |||||| |||||| |||||| |||||| |||||| |||||| |||||| |   GGAUUU GGAUUU AGAUUU GGAUUU GGAUUU AGAUUU GGAUUU GGAUUU AGAUUU GGAUUU GGAUUU A A CA      G      G      G      G      G      G      G      G      G      G      G G |
Stem-loop sequence | UUUAGGGUUUAGGGUUUAGAGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGAGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGAGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGAGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGAGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGAGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGAGUUUAGGGUUUAGGAC |