Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_bol_miR91
Species Brassica oleracea
Class miRNA
Genome position ChrC2:48005471-48005675 [-]
Reference genome BOL
Source SRR961925
Length 27
Mature sequence(if miRNA) 179 - AGAGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGAUC - 205
Stem-loop(if miRNA) --   G      G      G      AU     G      G      G      G      G      G      G      G      G      G     
  AGA UUUAGG UUUAGG UUUAGG  CUAGG UUUAGG UUUAGG UUUAGA UCUAGG UUUAGG UUUAGA UUUAGG UUUAGG UUUAGG UUUAGG
  ||| |||||| |||||| ||||||  ||||| |||||| |||||| |||||| |||||| |||||| |||||| |||||| |||||| |||||| |||||G
  UUU GGAUUU GGAUUU GGAUUU  GAUUU GGAUUU GGAUUU GGAUUU GGAUUU GGAUUU GGAUUU GGAUUU GGAUUU GGAUUU GGAUUU
GA   G      G      G      GG     G      G      G      G      G      G      G      G      G      G     
Stem-loop sequence AGAGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGAUCUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGAGUCUAGGGUUUAGGGUUUAGAGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAG