Search result

BaseInfo

ncRNA ID	CNT0018057
Species	Zea mays
Class	lncRNA
Genome position	6:4609071-4691420[-]
Reference genome	NA
Source	CANTATAdb
CPC status	coding
CPC score	14.0492
Max peptide length	3400
Max expression	15.5
Potential function	splicing regulation
lncRNA sequence	GCAAGGACTCGTCCACGGAGGCCGAGCAGCAGAGGCACACGAATCGCCGTTGCCTCCGCCGTCCGCCTCCTTCTCCAAGCAAACGGAACTGAAAAGAAAAGGTCCCGCCCCGGCGGCGGCACCCGACTCTCCATCCACCGCTCGCCTCCCCTTGCCCCTCCTCTCGTCTACTCGTCACCCTACGCTCGGCTCCATCCTCCCCGCCTCCCCACGTGTCCTCCCGCTACATGGGAGCGCGGGCTCCCTAGGGTGCCTCGACCACCGCCGCCGCCATGTTCGAGGGGGTGGTAAGCCAGGTGCTCTATGGCCTCCTCCGCCGCTACGTCAAGGGCATCCAGAAGGAGCAGCTTAAGATCGGCATCTGGAAGGAAGAAATACTGCTTGAAAATGTAGAGCTGATTCTGGAAGCCTTTGACTACCTGCAGCTGCCATTCGCGCTGAAAAATGGACGAATTGGGAAGCTAAGCATCCGGATTCCTTGGAAAAAGCTAGGATGGGACCCTATCATTATTGTCATAGAAGATGTCTATGTTTGCGCATGCCCAAGGGAGGACTCTGAGTGGAGCTCAGATTCTCTGGACAAGAGGGAACTAGCTGGAAAGTTGGCTAAACTTAATGCCATTGAGCTTGCTAAATTTTCTAGAAGAGTTACAGATAATCAAACGGGACAATCATTTTTGTCCTACATATCAGCAAAGATACTGGATAGTATCCAAGTTTCTATGCGAAATGTTCATATTGTATACATGGATACCCACAACGGTCAAGGGAACTTTGTATTTGGTTTGGAATTCACAAGTCTCTCAATACAAACAGATACCCAGAAGCAAAGTTTTACAATTTCATTGATGACTAGGTCAAGACAAGATGAAGTAAATAAGATAATTGAGATATCAAATGTTGGAATTTACTGTCATCAGCTGGAAGAAGAGCAGGATCTATGCCATGTTGGTGCTCTTGAAAATGACCACTCAAGGGATTATCTTGTAAATCCATTTTGTGTGACTGTATCTGTGCTTGCTAACAAAGCTGCCAAGCTTGACGGTACCCCTCAGTATAACATGACTGCAGAGCTAACTGCATTGGCCCTATCTGTTGATGAAATCCAGCTCCAACAAATCTTAAATCTTTGTGATTACTTCACTATCTGTGCTTTGCGAACAAAATATGGTCGTTACCGTCCTTCTCAAAGCTCTTTATCTAAGAGATGTAAAGGTTGGTACAGAATGTGGTGGCAATATGCTCAGAATTCTGTATTAGCAGATGTTCGCAGAAGACTGAAGAAAACTTCATGGCGTTATTTGAAGCAGCGACTGAATCACCAACTAAGATATGTGAAATTGTACAGAATGAAATTGGAGCTTTTACAGAAAGGACAGATTGTTAGTGAAGACATTCTACAAGAGTTGGAAAATATGGACAGAGAATGTGATATAGATGACATACTTAACTACAGAACGATTGCAGAGCAACAACTGCAGGAATCATTGGTGAAATCTTCCATAGATACTCATAGTCCAGGAAGTCCTCGAAGCGATGAACAGTTGGCAGGGGCAAGCCAGGGATGGTTAAACTGGCTTTCTCTTGGAATGCTTGGTGTTGGTGGAACAGCTGATAGTAGCTCATTTGCTGGTGTTATTTCTGAAGACATTATTAAGGATATATATGAGGGAACAGAATTTCGTCCAGTTTCTTCTGCTGAAAATTGTTTGAAGAAAGAAAACTACTATTCTTTGTTTGTTAGACTATCTATTTCTCAGATAGTCACAACTGTCACCTCCAGGAGGTTTGGCACGAAGCTTGTAGATACAATGTTTTCTGGGCTTGGTATGGAATGTAAAATATGGGATGATGCAGCAACTATTCTTGCTTGGCTTGATTCTCTTCGGGTTATCAACCCACTGAATAAAACGAAAATCTTATGGGCTGAAAAGTGTAGCACCGGTGATGGTCTTGGGGCACCTGTTGTCAGTATCCAAGTCGACTTTCCCAAGTCAAATGAAAGATCAGAAGCTTCAACAAGGGTCGTTGTCCAGGAATTCAACGCCATCTATGAACCAGAATTCTTTGTTAATGTCCTGTACATCTACAATGTGTTTTCCGCTTTCCAATTTCAGCATGATAGGGTACTTTCTTCTCTAAATCGGTTCAATAATTTGGGAACAAGACTTGTCTCCAAACTGAAGTACATGTCTGCTAATCGTAAAAAACTTATTTGGGATTTGAGGATTTATCATTTCGTCATTAGGATACCATCACAGAATTGTGAAAGGAAAGAACTTGCCATGGTTATTGATGCTGGGGATGTATTCATTCAGTCTAAAGATACAATTGACGATATTTCTCGAACACAAGAAAGCAATTCCTTTCTTGATCACATATCAAAAAGTCTTCCTAGTTATTTTTCTGATGATCTGTTACTCGGTATCCAGTTGGATGAGCTTTATAACCAGTTTGAGCTTGGCCTTACTGGGTTTCAGGTGAAGGTATTGTTGCCTGACAGACATAATGTTTCCTCTACACTGATTAAGCTTGATGCTTCCATTGCACTTCGATTGTGTGTATTCCTAGATGAACCAGTGCTAAAACAATTGGAGGTCGGTTTTATTGTGTCATCTATTGATGCATACCTCTCTCAGACAATGTACAGTACCATTGTTAATTTGCCTAGAATGAAAGAAACTAACCTTTTCAAGAACAGCGTATTTGATAATACCAAGACACATGTACCCAAGAAATTGGCCTTGAATGTGTCTGTGTCTCTGAAGCTCGCCAAGTTAGGTTTACATGTTGACCTTGATGGTAATTTTGAGGAAAGTTCTGGTCTCATTGTTGGCATTGAAGACATTGATATCAGGTATGCTATCTGTGAATTGTCAGATCTTTCTCTTGCCATGAAGACGGTCAATGTTACTTTCAGATATTGGAAGGATAAATCAGATTCACATGTGCTATGCTTATCTGGGAACTTAACACGATGTCCTGAAAATTCTGTTGAAACTTGTTTGGATCTGCATTATAGAACTCACAAGCATGACGATCAAATACATCATGTATACCGGCTGATTTTATGTGATGTTGATCTGCATGTTAACCCATCTGTTATTGGTCAGATAAGGATGTTTTTAAGAAAACTTGATTCAGGACCTTCAATTGGCAGTGATGTTGAATCCACAATGATTGGTCAGAGTTCCATGAAATCCGGGGCAGCTAATGGCATACTTCCCATGTTCTTTTTGTCAAATTTATGTGGTGCAGATGGCACTGTATTCGCAGGAGTTTCTGTTGACCACTTCCCATTTTTAGTTGCAGATCACAGTTGTGGATATAATTTTGGGTGCTTAGGAACTCAAAATGTTGAAGCACAAGAAAGTTTATACTCAAAGAATGAGCACTGTCATGACACTTCAGGTTTGAATGGTTATCATGCATCAGATCTCACCAGCAATACATACGGTAAAACCCAGCGTTCAGATTGTTCATCTGGCTCATCAAATGACCCCAAGAATGCCAGCAGAACTGTTCTGGATCTATCACTTATTTCTGTTAGAATACATTTTCCTGAATCATGTGGTACTTTAGTAACAATAACCATTCCTGAATCGATATCAACACTCACTTATTTTGATGCAAGCTCATGGGACTTACTATTGTCTGCTAACAATTTGACTCTTGCTTCACCATGGACTCCACCAAATGTCAACGAGCTGGTCTGGGGCACAGCTTCACATCGCAATGCTAGTGTACTCAACGTTCGAGTTAAAAAGGACTTACCTGCACTGTCAACCGAAGTATGTGTTGGAATTCAAAACGTTTGTTGTGTATTACCATCCAAGTTACTGGCTATGTTTGTTGGATTCTTTTTGTTGGATGATTGGAATCGTATTGCAGAACAGGAATTCCTTGTGGCAGATAACAACCTTGAAGGCTTGAGAGAATCACATGACTGTGTAACATATAAATTTGATATCAGTGATTGTGTTGTATTTTTTCCTGTGGAAGAGCAAGGTTTATCGTGTCTAAAGCTGGAGGTTCCACATTTTTTCTGTGAGTTCATTGCGAACGGAAGCTCTGTAGAATTTGCAAAGCGTATCCCCAAAGAATTCTTCAGTTCAGAGTGCATAGTTTCCAGAAGAGTTGATGTCATCTGCATATATGCAAGAAATGCATCCATATCACTTCTAATTGTAAGCGACCAAACAGATTTTATGCTAAAGCTTGATGAGAACGTTCCTAAGAGAATCCATTCTCTTATTGAAAAGCTTGATGCCGACGTATGGATTCAGGTTCCTTGCAAAGATATACCATACTCGCAGCAGCCTACTTCACCTACCTCCGTTATGAGCAAAATATCACGATGCAACTTGATTGCTGAAGATTTATATTTTATAAATGGGATGGAGACAGTTATTGGTGTTGTTGACCAGTTGATTTCGATCGGCAATGAAAGTAAAATGTACAAAGGCAATGCCTCACAGTTTTTAGATCATAGAAGTTTCTGTGAGGGCAACCCTGATCCTAATGAGTGTACCAATCTCACTATTTCGATCAAGGATCTGATGATTCTCTTGGGCCAGTCTAAAGCTAAAGGTCTGGCACTGGAGAGGATTGCCACTGCAAACATGGAGTTTGATGTTTCTGCTGTACTAGTTGGTGAAAAACCAGAGCGCATAGACTTTGACGTTGTTTCTTTAACACTGCAGTCACCTGGTGGTTACACACTCATCTCCATTGTTTCGGATGGGCCACTATCTCCTGTTTTTTTCAAGTTTACAAAGCACCATACTGGACAAGATGAGATATTACTAAGTGTACCCCTTTTTGAGATCTGGTTATATTTACAGGATTGGAATACAATTATCAATCATTCCCATTCATACATAAAGACAGAAGTAAACAGTATGCCTGTGGAGCATGCAGCTGCTTTGTCTCAGTTTCCAGAAATGGTATCGTCACCACTTATTGCATCAGAATTTGGTTCACCAGATGACTTCAACTTAGTGGTAACATGTGAAACTATTTCTGGTGTACTCCATATACCTATCTGGGGGAAAGAAGAAAATCACACAAGCAATCACATGGGTGTGACTCCTGCTTCTTTTCCAATGGAAGTGGGCACTCATGAGACAGATGATATTCAATATTGTGAACCAAAAGGTTGCAAGTTTGTCACCTTAACTTTTGATACTAAACATTTTGTGGTGATGTCAGGTGATAGCTGCATAAATTTTAGATGTGATTTAGAGAGATTGAAGGTATTGCTGGAAATGATTCAAGAGAATAAGGGTACCTCTGTTCCATTTGTGCATATATCTAAGGTTAAATCTTCTGGTTATGTTCGTCAATCAGAAAGGAATTTGGAACATCTTTCTGTTGATCTACAAGCTGAATACATGGATGTTAGTTTTTCACACCAGATATTTAACTTCTGGCATAACATGGAACTCAAATTTCCTGCTGCATCATCTGCATCCTCTTTTTATTCTGTGGCATTCAAGGCAGGATTGAGGAAAGGGTCTCTTCTGCTAAGCGATGGAAGGTGGAGCAGTCATGGACCTGTAATAGAGACGTTATTGAAGAATCTAACTGTGCAGTTCAGTCAAATGAAGGATAGGACAGAAGTGTCTGCTTTTGTTGACCTTTTAGTAAATTACAATAACATTGATAAGGTTATGTGGGAACCTTTTGTAGAACCCTCAAGATTTCAGTTAAATATGCTAAGAAAATGTGGTGATTGTGGATTGGATATATCACCCAGTACTGATGTGTGTTTAAGTTCAAGCAAGCAGCTTAATCTGAATATATCAGAACCCTTAATTGAGGCTCTTCTCAGACTTAACCAGATGATTACAGATTCTCTTGATCCGAGTAATGGTAGTGGTATTTGGGAAGATCCTGGAATCTTGAGATTAAACCATGATGATGTTCGTACCAGAAGATACGCACCATACTTTCTCTCGAATGACACATCATTGCCCTTTAGGTTCAAGGTGTACCGAGGTGCTGTTAATTCAGATGATATTGGCAGTTTCTCTGTAATAGATGAAAACTCTGTGCCGGCGGGGTATGCTGTCCCAATTTACGTCGAAGAAACTCCTGATGAATTTTTCTTCCAACACAGAGAAGCACGATCATCAGACCATCTCATCGAGAAACGAATGAGTGCTCTATCACACTACATGATCTCCATTGAGTTTGATGGAACATCAGGCCCTTCAAAACCAATGTCAATGGACCTTGTGGGCATTTACTTCTTTGAAGTAAATTTCTCTTCAAGTAAAAAGCCAATTCTCGGCGAAGAAAGTTTAGGAGCATTTTCGTCTAATGCAAAAGGCAACGATGGGTTAATTGTGCCTGTGGTGCTCGATGTTTCCTTACAGAACTACAGCAAGCGTATACGAGTTTATTCGACGGTAATACTATACAATGCAACATCAATGCCCCTCGAGTTGAGGTTTGATATACCATTTGGTCTTGCATCAAAGGTAATTGGGCCCATTCCTCCAAACAAAGAGATTCCACTGCCGGTTCATTTGTCTGAAGCTGGCCAGATTAGGTGGCACCCTGTCGGCAGAACATACTTGTGGAGTGAAACCCGCTCCTTGTCAAGTTTGCTTTCACGTGAAAACAGGGTTGGGTTCATGAAATCATCTGTTTGTTATCCTTCTCACCCTAGTAATGACCCATTTCGTTGTTGTGTATCTGTTGAAGAATACAATGTCCCTTCATCTGTTAGTACCAAGAAAAAACAGTTGTGCAGTGAAAGATTGAACACACAAGTTTCTGGAAGTTCTACTCCAAATACTTTTAAGCAAAATTTGACAAGGACACATTTTATACGGCATGTCAAGCTTAATACCCCGCTTCTCATAAAGAACTATCTGCCTGTTTACATTTCCTTGGCAATAGATAATGGTGGGTCTGCGCGGGTAATTTCGCTAAAGGAGGTAGGGTCTGCCTCTATTTTGTTTGTTGATCCCTCCAATGATCTTGGAATTACAATTGATATTCAAGATTATAGGTCCTTGAACATAAAGTTTCCCCGGGCTGAATCATTCTCAACTACAGCCAAGTTAAATGGCTTCAAATTCTCCATAACTGAGTCAATTACTTTCTACTCAAATTTGTCTAATTTTCCTCTTAATGTTATGCTGGAAAAATCAATGGATGCTCGTTCTGGCGCAAGAGAGTTGTATCTTTCTGTTCCATTCTTGTTGTACAATTGCACAGATCTATTGCTTACTGTCACTGAAAGCAGCTCTGAGAGGAGTGGGCCTACTCTTGTGATTCCCCCTAGTTTTGAATTGGATGGATATGCAAGACATATGCTTGAAAAGGGTGGTCTTTCTCTTGTCAATCCTTCTGTACAATGCTTTACAGGCAAAATGCCCCAGATATATTTGATGGATGGACACTGCTCTTCTTCAGATATAAGTTGTACACGTAACAGTGAGTCTGTAAAGAAAGATTTGGACAACAGTGTTAAAGCTTATATGTTTGCTCCTGATGGGCACACTCCAGCAACTGAACTTTCAGTTAAGTTGAATGCTTCTCCGCCTAATAATGGAACTGAAACAACTCGGCGAAATTGGTCAAATCCCTTCCTCCTTGTCCCTGCCAGTGGTTCAACAAATGTTACTATTCCTCAGTCATCTACTTCTGGTGCCTTCTTAGTTGCAGTGGCATCTATACCTGTTTCAACAGAACTTTTTGGCAGGACAAGGGCTATTGCTTTCAGGCCAAGATACGTCATATGTAATGCATGCAGCAATGATTTGTTCTTTCGACAAAAAGGAACACGGTTTTCTAAGCACTTAAGTTCTGGGCAACACTCTTTTCTTCACTGGTCTGATACAGCCAGAGATCTGCTGGTATCCATTCGGATTGATGGCCCAGGATGGCAATGGTCAGGAAGTTTTTTCCCTGATCACCTGGGAGATGCTCAATTGAAAATGCGGAATAGTGCCTCAGGTTTATCATATATGGTTCGAGTTGAAGTGCAAAATGCCGATCTAGACTTAAACAGCAATAGATTTTCTGGAAAAAATAATATCAATACTGGTACAGTACTGATTCTGCTTTCTGATGATAAGACTGGTTTTGTACCTTACAGGATCGACAATTTTTCAATGGAGAAACTGCGGATATATCAACAGAGATGTGAATCTATTGAAACAATTGTTTATCCCTACACATCCTGTCAATATGCTTGGGATGAGCCTTGCTATCCTCATCGCCTTACTGTTGAGATTCCTGGAGAACGGAGTTTGGGTACATTCAATCTGGACATTCTCAATGATGATGTTCATGTGTCACTACCATCCACATCCGAGAAAGCTGCAAGACAATTCTGCATCTCAATACATGCGGAAGGAGCAATTAAGGTGCTAAGTGTTCTTGATTCAAATTGCCACAATAAGGAAACAAATGAAAAGGATTTTCTGGGATCAAAGGAACCTAAAGTTGTTGATCACAAACTGGAGCTTGATATGAATTTTGCTGAGGTTATCAAATTACACTTACCATTCATCGGGATATCTTTAATAAGTTCTTGTCCACAGGAATTGTTGTTTGCTTCTGCCAAGGAGATGACTGTTGTTGCCATGCAGAGTTTAGATCAGCAGAGATTTACGGTTCAGATACAATCTATGCAAATCGATAATCAGTTCCCTGATAGCCCACACCCGGTCATGTTGTCATTTGAGGGCAGTCATAAGGGAAAATCCATGAACTTTTTTAAGAGTAAAGATACTAAGCTGAAATCAGCAAATGACATTCTTTCCAGTACCAGTGAACCTGTGCTGCAGTTTGCTGCAGCTAAATGGAGAACCAAAGATGTATCATTTGTTTCCTATCAATATATAAACATAAGTCTAGCACCTCTTCGCCTTGAACTTGAAGAACGACTTGTCTTGAGCATGATTGAATTTTTTAGATCTGTTTCCTCTCGAATAAATATTGGACACTTGGAGAAAAGTATTGAGCTAAGTATAGGTGGTGCTACGGACATGTTAAGAGAATATGAAAAAATCTCAAAGAATATATCAGACAAGCTCCTGGTGCAAGACAGTGAATTGTTGCCTTCTGTTGTCCCAGTTGGGGCTCCATGGCAACAGATACACCTTTTAGCCAGAAAACAGAAAAAGGTGTACATTGAATTGTTTCAGTTGACTCCTGTCAAGTTGACTTTCAGTTTTACGAGCACACCTTGGCTCAATAGGAATGAAGGTGGTTCAGACCCCAGCGTAGGTTTCAACAACGCTACTGCAATCCAGAGAGGTCTTATGGCCCTCTTGGACGTTGAAGGAGTACCAGTTTACCTTGGAGAAATTATAGTGGAAAATCTTATGGCCAGCTGGCAATCTGTTCAGGACATTCTTATGAGGCATTATAGTAGGCAAATCCTCCACGAACTTTATAAGGTTTTGGGTTCTGCTGGCGTTATAGGAAATCCTATGGGTTTTGCTAGGAATGTTGGGTTTGGTTTAAAGGACTTCATATCTGCTTCAAGAAAAGGGAAATTGCAGAGCCCAGTTGAACTATTAAACGGTATAGCACAAGGTTCAAAGACTCTTATTGGAAGTACGGTTTATGCAGTCAGCAGTGCCACTTCTCACTTCAGTAAAACTGCTTATAAGGGCCTTGTTGCCTTTACATATGATGAGCAAGCTGCTTCGAAGATGGAAGAACGGGAAAGACAGCTAGGTTTGCATGGGGAAGGAGTACTGAATGGTTTTCTAGAGGGTCTGACTGGGCTCCTTCAATCACCGATTAGGGGAGCTGAGAAACATGGTCTTCCCGGGGTCATCTCAGGTTTAGCAATGGGAACAGCTGGGCTTGTGGCACGGCCTATGGCTAGCATTCTTGAAGCCACAGGCAGAACTGCCCAGAGCATTAGAAACCGAAGCAACCCTCACGAATCCAACTACTTGCGAGTACGTTTCCCCAGGCCTGTTGCCAGAGATCGCCCTTTGTTTCCCTACTCCTGGGAAGAAGCCATCGGTGAATCGTTGCTTGCCCAAGCTGACAGTGGCAGACTAAAGGAGGAGACATTTGTCATGTGCAAGACACTCAAGGGGGCTGGGAAGTTCCTTGTGCTAACTGAGAAGCTGCTTCTGCTAGTCTCAAGCCCATACTTGGTGGATCTAGGATCGCCTCGGTTCATCGGTGTTCCTCCTGACCCGCAGTGGTCGATCGACACGGAGATGCACCTCAAGAGCGTTGTTCATCTGGACAGGTCTCAGGAGGTAGTGAACATTGTTGGGAGCAACGGACAGACCTCACCTAGGGACAAAAGAGGTGGCACGAGAAACAGGGTCATGAGCTCGGCCTTCGTCCCCCTGTTTCACCTCAGCATAGAGCTGCCAAATGAGGAGGATGCAGAAGGGACGGTGCAGGTCCTACAGGCACTCATCGAGAAGGGCAAGGCACGGAGGTGGGACAAGAACATCCTACACCGGAGCAACATCAGTTGAGGTTTTCACAACAGTAGTAGAGGTTGGTGTTTTGATTGAAGTGGAAGATAAACTAAATTCCACCCCGTGACTCAGGTGGATTAAATATACAAACAAGGCCTCAAGGCAGAGCAGTCACCAGCATACATAAGCTTAGTGTGAATAAGAAAACAAAGTGTTCCATAGGTGATCACCGTTGGACACGTGCTTCGGTTTTTTTTTTTTTTTTGCGGTCTAGGTGTAGCTTCTAGAAGTTTTGTCGACGGCTCTTGTAAATGAAGTGTGAGAGGGCTTATGTTATGTGTAGCAACACCACTGTTTTATGCCACGGCTATGTTTACAAACTTCGCCGTTCATGGGCCATGGATATTTCTGATTTCACCATAATGAACTTAGCGGAGGTAGGGGGTACGCTGACAAACGTATTGTCGAGTAGTCGAACTGTCATTAAAGGTTGTGGATCCAGGATTTAAATCTAGGATAGTCAAGAATAAAAAATATGTAATACCATGTATATTTAG