ncRNA ID | novel_bna_miR1230 |
Species | Brassica napus |
Class | miRNA |
Genome position | ChrA7:6095501-6095711 [-] |
Reference genome | Brassica_napus_assembly_v1.0 |
Source | SRR2015555 |
Length | 24 |
Mature sequence(if miRNA) | 188 - AGGAUUUAGAGUUAAAGGGUGGAG - 211 |
Stem-loop(if miRNA) |
--AGGA      G -    G      G      A      G A    G     GG      G      G      G      G      G      G      G U       UUUAGA U UAAA GGUGGA UUUAGA UUUAGG U UAGG UUUAA  UUUAGA UUUAGA UUUAGA UUUAGA UUUAGG UUUAGG UUUAGG U U       |||||| | |||| |||||| |||||| |||||| | |||| |||||  |||||| |||||| |||||| |||||| |||||| |||||| |||||| |       AGAUUU G AUUU UUAUUU AGAUUU GGAUUU G AUUU GAAUU  GGAUUU GGAUUU AGAUUU GGAUUU GGAUUU AGAUUU GGAUUU G A GAUUUG      G G    G      A      G      G G    G     AG      G      G      G      G      G      G      G G |
Stem-loop sequence | AGGAUUUAGAGUUAAAGGGUGGAGUUUAGAAUUUAGGGUAUAGGGUUUAAGGUUUAGAGUUUAGAGUUUAGAGUUUAGAGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGAGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGAGUUUAGGGUUUAGGGAUUAAGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGAAUUUAUUGUUUAGGGUUUAGAGUUUAG |