Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_bna_miR1230
Species Brassica napus
Class miRNA
Genome position ChrA7:6095501-6095711 [-]
Reference genome Brassica_napus_assembly_v1.0
Source SRR2015555
Length 24
Mature sequence(if miRNA) 188 - AGGAUUUAGAGUUAAAGGGUGGAG - 211
Stem-loop(if miRNA) --AGGA      G -    G      G      A      G A    G     GG      G      G      G      G      G      G      G U
      UUUAGA U UAAA GGUGGA UUUAGA UUUAGG U UAGG UUUAA  UUUAGA UUUAGA UUUAGA UUUAGA UUUAGG UUUAGG UUUAGG U U
      |||||| | |||| |||||| |||||| |||||| | |||| |||||  |||||| |||||| |||||| |||||| |||||| |||||| |||||| |
      AGAUUU G AUUU UUAUUU AGAUUU GGAUUU G AUUU GAAUU  GGAUUU GGAUUU AGAUUU GGAUUU GGAUUU AGAUUU GGAUUU G A
GAUUUG      G G    G      A      G      G G    G     AG      G      G      G      G      G      G      G G
Stem-loop sequence AGGAUUUAGAGUUAAAGGGUGGAGUUUAGAAUUUAGGGUAUAGGGUUUAAGGUUUAGAGUUUAGAGUUUAGAGUUUAGAGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGAGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGAGUUUAGGGUUUAGGGAUUAAGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGAAUUUAUUGUUUAGGGUUUAGAGUUUAG