Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_bna_miR1211
Species Brassica napus
Class miRNA
Genome position ChrA6:35467559-35467650 [+]
Reference genome Brassica_napus_assembly_v1.0
Source SRR2015555
Length 21
Mature sequence(if miRNA) 72 - GCUCACUCUCUAUCCGUCACC - 92
Stem-loop(if miRNA) --    A  -            C       GGCU   UU    AUU  A
  UGAC GA AGAGAGUGAGCA ACAUGGU    UUC  GCAU   GG A
  |||| || |||||||||||| |||||||    |||  ||||   || G
  ACUG CU UCUCUCACUCGU UGUAUCG    AAG  CGUA   UC A
CC    C  A            A       ----   UU    --C  U
Stem-loop sequence UGACAGAAGAGAGUGAGCACACAUGGUGGCUUUCUUGCAUAUUGGAAGAUCUCAUGCUUGAAGCUAUGUAUGCUCACUCUCUAUCCGUCACC