ncRNA ID | novel_bna_miR1137 |
Species | Brassica napus |
Class | miRNA |
Genome position | ChrA1:41719311-41719507 [+] |
Reference genome | Brassica_napus_assembly_v1.0 |
Source | SRR1363496 |
Length | 23 |
Mature sequence(if miRNA) | 175 - UUGGGUUUAGAGUUUACGGUUUA - 197 |
Stem-loop(if miRNA) |
---GAUA    A      UU    G      A      UU     -G     A   GG  UG   AUAUG  UU  G      G    U    UG     AGG        UAGG UUUGGG  CAGG UUUAUG UUUGAG  UAGGU  UAGAC UUA  UU  GAU     GU  GA UUUAGA UCCA GAUU  GGUUU   A        |||| ||||||  |||| |||||| ||||||  |||||  ||||| |||  ||  |||     ||  || |||||| |||| ||||  |||||        AUUU AGAUUU  GUUU GGAUAU GAAUUU  GUUUA  AUUUG GAU  GA  UUG     CA  UU GGAUUU GGGU UUGG  UUAGG   U AUUUGGC    G      GG    G      G      GG     GA     G   UU  GU   ----G  -U  G      -    -    GU     AUA |
Stem-loop sequence | GAUAUAGGAUUUGGGUUCAGGGUUUAUGAUUUGAGUUUAGGUGUAGACAUUAGGUUUGGAUAUAUGGUUUGAGUUUAGAGUCCAUGAUUUGGGUUUAGGAUAUAGGAUUUGGGUUUGGGUUUAGGGUUUACGGUUUGAGUUUAGGGUUUAAGAUUUGGGUUUAAGGUAUAGGGUUUGGGUUUAGAGUUUACGGUUUA |