Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_bna_miR1137
Species Brassica napus
Class miRNA
Genome position ChrA1:41719311-41719507 [+]
Reference genome Brassica_napus_assembly_v1.0
Source SRR1363496
Length 23
Mature sequence(if miRNA) 175 - UUGGGUUUAGAGUUUACGGUUUA - 197
Stem-loop(if miRNA) ---GAUA    A      UU    G      A      UU     -G     A   GG  UG   AUAUG  UU  G      G    U    UG     AGG
       UAGG UUUGGG  CAGG UUUAUG UUUGAG  UAGGU  UAGAC UUA  UU  GAU     GU  GA UUUAGA UCCA GAUU  GGUUU   A
       |||| ||||||  |||| |||||| ||||||  |||||  ||||| |||  ||  |||     ||  || |||||| |||| ||||  |||||
       AUUU AGAUUU  GUUU GGAUAU GAAUUU  GUUUA  AUUUG GAU  GA  UUG     CA  UU GGAUUU GGGU UUGG  UUAGG   U
AUUUGGC    G      GG    G      G      GG     GA     G   UU  GU   ----G  -U  G      -    -    GU     AUA
Stem-loop sequence GAUAUAGGAUUUGGGUUCAGGGUUUAUGAUUUGAGUUUAGGUGUAGACAUUAGGUUUGGAUAUAUGGUUUGAGUUUAGAGUCCAUGAUUUGGGUUUAGGAUAUAGGAUUUGGGUUUGGGUUUAGGGUUUACGGUUUGAGUUUAGGGUUUAAGAUUUGGGUUUAAGGUAUAGGGUUUGGGUUUAGAGUUUACGGUUUA