Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_bna_miR1077
Species Brassica napus
Class miRNA
Genome position ChrA5:15776366-15776534 [-]
Reference genome Brassica_napus_assembly_v1.0
Source SRR1363496
Length 23
Mature sequence(if miRNA) 147 - UAGGAUUUAGGUUUUAGGGUUUA - 169
Stem-loop(if miRNA) --                  G     UGUU    G      G     GGG    G      G     UG      -G     GGG
  UAGGAUUUAGGUUUUAGG UUUAG    UAGG UCUAGG UUUAG   UGGG UUUAGG UUUAG  UUUAGA  UUAAG   U
  |||||||||||||||||| |||||    |||| |||||| |||||   |||| |||||| |||||  ||||||  |||||
  AUUUUGGAUUUAAGAUUU GGAUU    AUUU GGAUUU AGAUU   AUUU GGAUUU GGAUU  GGAUUU  GAUUU   G
GG                  G     UGGU    G      G     GGG    A      G     UG      AG     GGG
Stem-loop sequence UAGGAUUUAGGUUUUAGGGUUUAGUGUUUAGGGUCUAGGGUUUAGGGGUGGGGUUUAGGGUUUAGUGUUUAGAGUUAAGGGGUGGGGUUUAGGAUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGAUUUAGGGUUAGAGUUUAGGGUUUAUGGUUUAGGGUUUAGAAUUUAGGUUUUAGG