ncRNA ID | novel_bna_miR1077 |
Species | Brassica napus |
Class | miRNA |
Genome position | ChrA5:15776366-15776534 [-] |
Reference genome | Brassica_napus_assembly_v1.0 |
Source | SRR1363496 |
Length | 23 |
Mature sequence(if miRNA) | 147 - UAGGAUUUAGGUUUUAGGGUUUA - 169 |
Stem-loop(if miRNA) |
--                  G     UGUU    G      G     GGG    G      G     UG      -G     GGG   UAGGAUUUAGGUUUUAGG UUUAG    UAGG UCUAGG UUUAG   UGGG UUUAGG UUUAG  UUUAGA  UUAAG   U   |||||||||||||||||| |||||    |||| |||||| |||||   |||| |||||| |||||  ||||||  |||||   AUUUUGGAUUUAAGAUUU GGAUU    AUUU GGAUUU AGAUU   AUUU GGAUUU GGAUU  GGAUUU  GAUUU   G GG                  G     UGGU    G      G     GGG    A      G     UG      AG     GGG |
Stem-loop sequence | UAGGAUUUAGGUUUUAGGGUUUAGUGUUUAGGGUCUAGGGUUUAGGGGUGGGGUUUAGGGUUUAGUGUUUAGAGUUAAGGGGUGGGGUUUAGGAUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGAUUUAGGGUUAGAGUUUAGGGUUUAUGGUUUAGGGUUUAGAAUUUAGGUUUUAGG |