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BaseInfo

ncRNA ID novel_bna_miR887
Species Brassica napus
Class miRNA
Genome position ChrC7:31852259-31852359 [+]
Reference genome Brassica_napus_assembly_v1.0
Source SRR538066
Length 19
Mature sequence(if miRNA) 83 - AGAGUGGGAUUCUUAGCGG - 101
Stem-loop(if miRNA) --A       CU    C       --C    U        G     UAAAC
   CUAAGAA  CCAC CUAAGAA   CCUA UAAUCAUG UCUUA     A
   |||||||  |||| |||||||   |||| |||||||| |||||     A
   GAUUCUU  GGUG GAUUCUU   GGGU AUUAGUAC AGGAU     U
GGC       AG    A       AUA    U        G     CACAA
Stem-loop sequence ACUAAGAACUCCACCCUAAGAACCCUAUUAAUCAUGGUCUUAUAAACAAUAACACUAGGAGCAUGAUUAUUGGGAUAUUCUUAGAGUGGGAUUCUUAGCGG