Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_bna_miR848
Species Brassica napus
Class miRNA
Genome position ChrC7:12028884-12029011 [+]
Reference genome Brassica_napus_assembly_v1.0
Source SRR537857
Length 27
Mature sequence(if miRNA) 102 - AGGGUUUAGAGUUUAGGGUUUAGAAUC - 128
Stem-loop(if miRNA) --A      G      A      G      G  UA      AG       GG  UA     UUGA
   UUUAGG UUUAGG UCUAAG UUUAGG UU  GGGUUU  GAUCUCG  UU  GGGUU    G
   |||||| |||||| |||||| |||||| ||  ||||||  |||||||  ||  |||||
   AGAUUU GGAUUU AGAUUU GGAUUU GA  CCUAAG  UUGGGGU  GG  UCUAG    U
CUA      G      G      G      G  --      AU       UU  GA     UAUC
Stem-loop sequence AUUUAGGGUUUAGGAUCUAAGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGAUCUCGGGUUUAGGGUUUUGAGUCUAUGAUCUAGGGUUUGGGGUUUAGAAUCCAGGUUUAGGGUUUAGAGUUUAGGGUUUAGAAUC