ncRNA ID | novel_bna_miR848 |
Species | Brassica napus |
Class | miRNA |
Genome position | ChrC7:12028884-12029011 [+] |
Reference genome | Brassica_napus_assembly_v1.0 |
Source | SRR537857 |
Length | 27 |
Mature sequence(if miRNA) | 102 - AGGGUUUAGAGUUUAGGGUUUAGAAUC - 128 |
Stem-loop(if miRNA) |
--A      G      A      G      G  UA      AG       GG  UA     UUGA    UUUAGG UUUAGG UCUAAG UUUAGG UU  GGGUUU  GAUCUCG  UU  GGGUU    G    |||||| |||||| |||||| |||||| ||  ||||||  |||||||  ||  |||||    AGAUUU GGAUUU AGAUUU GGAUUU GA  CCUAAG  UUGGGGU  GG  UCUAG    U CUA      G      G      G      G  --      AU       UU  GA     UAUC |
Stem-loop sequence | AUUUAGGGUUUAGGAUCUAAGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGAUCUCGGGUUUAGGGUUUUGAGUCUAUGAUCUAGGGUUUGGGGUUUAGAAUCCAGGUUUAGGGUUUAGAGUUUAGGGUUUAGAAUC |