Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_bna_miR835
Species Brassica napus
Class miRNA
Genome position ChrC4:11131442-11131537 [-]
Reference genome Brassica_napus_assembly_v1.0
Source SRR537857
Length 19
Mature sequence(if miRNA) 78 - GUCUAACUCUCAAGAUCGG - 96
Stem-loop(if miRNA) --G     C     A           CAAU     CU     AA     UA
   UCUAA UCUCA GAUCGGCUAUG    GCUCU  UUUGA  GAUUA  A
   ||||| ||||| |||||||||||    |||||  |||||  |||||  U
   AGAUU AGAGU CUAGCCGAUAC    CGAGA  AAAUU  CUAAU  U
CAA     U     C           ----     --     -C     UU
Stem-loop sequence GUCUAACUCUCAAGAUCGGCUAUGCAAUGCUCUCUUUUGAAAGAUUAUAAUUUUUAAUCCUUAAAAGAGCCAUAGCCGAUCCUGAGAUUUAGAAAC