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BaseInfo

ncRNA ID novel_bna_miR600
Species Brassica napus
Class miRNA
Genome position ChrC7:8917729-8917882 [+]
Reference genome Brassica_napus_assembly_v1.0
Source SRR537606
Length 22
Mature sequence(if miRNA) 1 - UCUCGUGUACAAUGAAUCAUUC - 22
Stem-loop(if miRNA) --   -         -U        C    -   CA   AUU  C      ----A   AUUCACAUCUAUAAACAAUGACA
  UCU CGUGUACAA  GAAUCAUU UCGU GUU  AUG   CU GUGUAC     GUG                       A
  ||| |||||||||  |||||||| |||| |||  |||   || ||||||     |||
  AGG GUACAUGUU  CUUAGUAA AGUA CAA  UAU   GA CACAUG     AAA                       U
AU   U         CU        C    A   -A   --C  U      AAAAC   GUAACAGUAACAUGUGCUUUUAG
Stem-loop sequence UCUCGUGUACAAUGAAUCAUUCUCGUGUUCAAUGAUUCUCGUGUACAGUGAUUCACAUCUAUAAACAAUGACAAUGAUUUUCGUGUACAAUGACAAUGAAACAAAAGUACACUAGCUAUAAACAAUGACAAUGAUUCUCUUGUACAUGUGGAUA