ncRNA ID | novel_bna_miR589 |
Species | Brassica napus |
Class | miRNA |
Genome position | ChrA4:12374465-12374577 [+] |
Reference genome | Brassica_napus_assembly_v1.0 |
Source | SRR537604;SRR537633;SRR537657;SRR537857;SRR538066;SRR538067 |
Length | 26 |
Mature sequence(if miRNA) | 88 - AGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGAUC - 113 |
Stem-loop(if miRNA) |
UUUAG        G      G      G      G      G      G      G U      GGUUUAGG UUUAGA UUUAGG UUUAGG UUUAGA UUUAGG UUUAGG U U      |||||||| |||||| |||||| |||||| |||||| |||||| |||||| |      CUAGAUUU GGAUUU GGAUUU GGAUUU GGAUUU GGAUUU AGAUUU G A -----        G      G      G      G      G      G      G G |
Stem-loop sequence | UUUAGGGUUUAGGGUUUAGAGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGAGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGAGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGAUC |