Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_bna_miR589
Species Brassica napus
Class miRNA
Genome position ChrA4:12374465-12374577 [+]
Reference genome Brassica_napus_assembly_v1.0
Source SRR537604;SRR537633;SRR537657;SRR537857;SRR538066;SRR538067
Length 26
Mature sequence(if miRNA) 88 - AGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGAUC - 113
Stem-loop(if miRNA) UUUAG        G      G      G      G      G      G      G U
     GGUUUAGG UUUAGA UUUAGG UUUAGG UUUAGA UUUAGG UUUAGG U U
     |||||||| |||||| |||||| |||||| |||||| |||||| |||||| |
     CUAGAUUU GGAUUU GGAUUU GGAUUU GGAUUU GGAUUU AGAUUU G A
-----        G      G      G      G      G      G      G G
Stem-loop sequence UUUAGGGUUUAGGGUUUAGAGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGAGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGAGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGAUC