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BaseInfo

ncRNA ID novel_bna_miR479
Species Brassica napus
Class miRNA
Genome position ChrC8:20863704-20863806 [+]
Reference genome Brassica_napus_assembly_v1.0
Source SRR537601
Length 24
Mature sequence(if miRNA) 1 - GUCCUGUGUGUGCUGACGGACAUC - 24
Stem-loop(if miRNA) --    U   U   -   A   A  UC  U        -  ------    U    A
  GUCC GUG GUG CUG CGG CA  CA GGACGUCC UG      UGUG GCUG C
  |||| ||| ||| ||| ||| ||  || |||||||| ||      |||| |||| G
  CAGG CAC CAC GGC GUC GU  GU CCUGCAGG AC      ACAC CGAC G
UG    -   C   A   G   -  GU  -        C  CGACAA    -    A
Stem-loop sequence GUCCUGUGUGUGCUGACGGACAUCCAUGGACGUCCUGUGUGUGCUGACGGACAGCCACAAACAGCCACGGACGUCCUGUGUGCUGGCGGACACCCACGGACGU