ncRNA ID | novel_bna_miR426 |
Species | Brassica napus |
Class | miRNA |
Genome position | ChrC6:16650057-16650226 [+] |
Reference genome | Brassica_napus_assembly_v1.0 |
Source | SRR537600;SRR537602;SRR537604;SRR537633;SRR537657;SRR537857;SRR538067;SRR538151;SRR538225;SRR538253;SRR527229 |
Length | 21 |
Mature sequence(if miRNA) | 150 - UUGGACUGAAGGGAGCUCCCU - 170 |
Stem-loop(if miRNA) |
--A          G      UU      CU  G U   A       A    -   AC    C   C  AA  C      --A  AAA    GAGCUUCCUU AGUCCA  CAGAGG  GU A AUG UCCAAUU GUUU CCG  UCAU CAU CA  UA CGAGUU   CU   U    |||||||||| ||||||  ||||||  || | ||| ||||||| |||| |||  |||| ||| ||  || ||||||   ||    CUCGAGGGAA UCAGGU  GUUUCU  UA U UAC AGGUUAA CAGA GGC  AGUA GUA GU  AU GCUCAG   GA   U UCC          G      UG      CU  G -   A       A    U   GU    A   A  AA  U      AUA  AUU |
Stem-loop sequence | AGAGCUUCCUUGAGUCCAUUCAGAGGCUGUGAUAUGAUCCAAUUAGUUUCCGACUCAUCCAUCCAAAUACCGAGUUACUAAAUUUUAAGAUAGACUCGUUAAAUGAAUGAAUGAUGCGGUAGACAAAUUGGAACAUUGAUUCUCUUUGGUUGGACUGAAGGGAGCUCCCU |