Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_bna_miR426
Species Brassica napus
Class miRNA
Genome position ChrC6:16650057-16650226 [+]
Reference genome Brassica_napus_assembly_v1.0
Source SRR537600;SRR537602;SRR537604;SRR537633;SRR537657;SRR537857;SRR538067;SRR538151;SRR538225;SRR538253;SRR527229
Length 21
Mature sequence(if miRNA) 150 - UUGGACUGAAGGGAGCUCCCU - 170
Stem-loop(if miRNA) --A          G      UU      CU  G U   A       A    -   AC    C   C  AA  C      --A  AAA
   GAGCUUCCUU AGUCCA  CAGAGG  GU A AUG UCCAAUU GUUU CCG  UCAU CAU CA  UA CGAGUU   CU   U
   |||||||||| ||||||  ||||||  || | ||| ||||||| |||| |||  |||| ||| ||  || ||||||   ||
   CUCGAGGGAA UCAGGU  GUUUCU  UA U UAC AGGUUAA CAGA GGC  AGUA GUA GU  AU GCUCAG   GA   U
UCC          G      UG      CU  G -   A       A    U   GU    A   A  AA  U      AUA  AUU
Stem-loop sequence AGAGCUUCCUUGAGUCCAUUCAGAGGCUGUGAUAUGAUCCAAUUAGUUUCCGACUCAUCCAUCCAAAUACCGAGUUACUAAAUUUUAAGAUAGACUCGUUAAAUGAAUGAAUGAUGCGGUAGACAAAUUGGAACAUUGAUUCUCUUUGGUUGGACUGAAGGGAGCUCCCU