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BaseInfo

ncRNA ID novel_bna_miR233
Species Brassica napus
Class miRNA
Genome position ChrC6:23005983-23006154 [+]
Reference genome Brassica_napus_assembly_v1.0
Source SRR527233;SRR527234;SRR527229
Length 21
Mature sequence(if miRNA) 1 - AGAGCUUUCUUUGGUCCACUC - 21
Stem-loop(if miRNA) ---A     UU   UG     CU A     UAAUAU    -       -C  A    C  C        C  CA     A   AAA   U
    GAGCU  CUU  GUCCA  C UGGAG      GUGA GAUUUAA  UG CUCU GA UCAUUCAU CA  UACCA AUG   GAA A
    |||||  |||  |||||  | |||||      |||| |||||||  || |||| || |||||||| ||  ||||| |||   ||| U
    CUCGA  GAA  CAGGU  G AUCUC      CACU CUAAGUU  AC GAGA CU AGUAAGUA GU  AUGGU UAC   CUU G
UUUC     GG   GU     UC C     ----UU    U       AA  A    U  U        A  AA     A   --C   U
Stem-loop sequence AGAGCUUUCUUUGGUCCACUCAUGGAGUAAUAUGUGAGAUUUAACUGACUCUCGACUCAUUCAUCCACAUACCAAAUGAAAGAAUAUGUUUCCCAUAUGGUAAAUGAAUGAAUGAUUCUAGAGACAAAUUGAAUCUUCACUUCUCUACGCUUGGACUGAAGGGAGCUCCUUU