ncRNA ID | novel_bna_miR233 |
Species | Brassica napus |
Class | miRNA |
Genome position | ChrC6:23005983-23006154 [+] |
Reference genome | Brassica_napus_assembly_v1.0 |
Source | SRR527233;SRR527234;SRR527229 |
Length | 21 |
Mature sequence(if miRNA) | 1 - AGAGCUUUCUUUGGUCCACUC - 21 |
Stem-loop(if miRNA) |
---A     UU   UG     CU A     UAAUAU    -       -C  A    C  C        C  CA     A   AAA   U     GAGCU  CUU  GUCCA  C UGGAG      GUGA GAUUUAA  UG CUCU GA UCAUUCAU CA  UACCA AUG   GAA A     |||||  |||  |||||  | |||||      |||| |||||||  || |||| || |||||||| ||  ||||| |||   ||| U     CUCGA  GAA  CAGGU  G AUCUC      CACU CUAAGUU  AC GAGA CU AGUAAGUA GU  AUGGU UAC   CUU G UUUC     GG   GU     UC C     ----UU    U       AA  A    U  U        A  AA     A   --C   U |
Stem-loop sequence | AGAGCUUUCUUUGGUCCACUCAUGGAGUAAUAUGUGAGAUUUAACUGACUCUCGACUCAUUCAUCCACAUACCAAAUGAAAGAAUAUGUUUCCCAUAUGGUAAAUGAAUGAAUGAUUCUAGAGACAAAUUGAAUCUUCACUUCUCUACGCUUGGACUGAAGGGAGCUCCUUU |