Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_ath_miR1038
Species Arabidopsis thaliana
Class miRNA
Genome position Chr1:15258758-15258970 [-]
Reference genome TAIR10
Source SRR1266863
Length 22
Mature sequence(if miRNA) 192 - UUCCGGAAGCCUAAAGUAGGAC - 213
Stem-loop(if miRNA) --    G            --AGGA    GG  UU    UU GG     -AU G      G      G    GG  -  GG UU    -G     G       G    A
  UUCC GAAGCCUAAAGU      CUUA  UU  AAAG  U  GAUCU   G UUUAGG UUUAGG UUUA  UU UA  U  UAGG  UUUAG UUUAAGG UUUA G
  |||| ||||||||||||      ||||  ||  ||||  |  |||||   | |||||| |||||| ||||  || ||  |  ||||  ||||| ||||||| ||||
  GAGG UUUUGGAUUUUA      GGAU  GG  UUUU  G  UUGGG   U GGAUUU AGAUUU GGAU  GG AU  G  AUUU  GAAUU GGAUUUU GAAU U
UU    G            GAAUGG    UU  GC    GG AU     AUU G      G      G    UU  G  UU GU    GA     G       G    U
Stem-loop sequence UUCCGGAAGCCUAAAGUAGGACUUAGGUUUUAAAGUUUGGGAUCUAUGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGUUUAGGUUUUAGGGUUUAGGUUUAAGGGUUUAAGUUUAAGGUUUUAGGGUUAAGAGUUUAUGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGAGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUUCGGGUUUAGGGGUAAGAUUUUAGGUUUUGGGAGUU