ncRNA ID | novel_ath_miR1038 |
Species | Arabidopsis thaliana |
Class | miRNA |
Genome position | Chr1:15258758-15258970 [-] |
Reference genome | TAIR10 |
Source | SRR1266863 |
Length | 22 |
Mature sequence(if miRNA) | 192 - UUCCGGAAGCCUAAAGUAGGAC - 213 |
Stem-loop(if miRNA) |
--    G            --AGGA    GG  UU    UU GG     -AU G      G      G    GG  -  GG UU    -G     G       G    A   UUCC GAAGCCUAAAGU      CUUA  UU  AAAG  U  GAUCU   G UUUAGG UUUAGG UUUA  UU UA  U  UAGG  UUUAG UUUAAGG UUUA G   |||| ||||||||||||      ||||  ||  ||||  |  |||||   | |||||| |||||| ||||  || ||  |  ||||  ||||| ||||||| ||||   GAGG UUUUGGAUUUUA      GGAU  GG  UUUU  G  UUGGG   U GGAUUU AGAUUU GGAU  GG AU  G  AUUU  GAAUU GGAUUUU GAAU U UU    G            GAAUGG    UU  GC    GG AU     AUU G      G      G    UU  G  UU GU    GA     G       G    U |
Stem-loop sequence | UUCCGGAAGCCUAAAGUAGGACUUAGGUUUUAAAGUUUGGGAUCUAUGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGUUUAGGUUUUAGGGUUUAGGUUUAAGGGUUUAAGUUUAAGGUUUUAGGGUUAAGAGUUUAUGGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGAGUUUAGGGUUUAGGGUUUAGGGUUUUCGGGUUUAGGGGUAAGAUUUUAGGUUUUGGGAGUU |