Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_ath_miR857
Species Arabidopsis thaliana
Class miRNA
Genome position Chr2:12175015-12175135 [-]
Reference genome TAIR10
Source SRR1163718
Length 24
Mature sequence(if miRNA) 1 - GUGGUCUGAUCUUGUUCUCGAACA - 24
Stem-loop(if miRNA) --   U      U     AU    U   C GA     C  --A         U    AGAC
  UUC AGAACA GAUCA  CCAU GAA A  UUAAA GU   UAGUUGAAA UGAA    A
  ||| |||||| |||||  |||| ||| |  ||||| ||   ||||||||| ||||    A
  AAG UCUUGU CUAGU  GGUG CUU U  AAUUU UA   AUUAGCUUU ACUU    A
AC   C      U     CU    C   A AC     U  CCA         C    AACC
Stem-loop sequence UUCUAGAACAUGAUCAAUCCAUUGAACAGAUUAAACGUAUAGUUGAAAUUGAAAGACAAACCAAUUCACUUUCGAUUAACCAUUUUUAACAUAUUCCGUGGUCUGAUCUUGUUCUCGAACA