Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_vvi_miR250
Species Vitis vinifera
Class miRNA
Genome position Chr13:7963754-7963843 [-]
Reference genome 12X
Source SRR1528351
Length 25
Mature sequence(if miRNA) 1 - UUGGAUGGUUUGGUGUUUUGAUGAU - 25
Stem-loop(if miRNA) --    UUU    UG   G   UG    --CU    ---A   -   A
  CGUC   ACAU  AAU GUU  AUGU    UGUU    AUC AUG C
  ||||   ||||  ||| |||  ||||    ||||    ||| |||
  GUAG   UGUG  UUG UAG  UACA    ACAA    UAG UAU C
UA    UUU    GU   G   GU    AAUC    CCAA   A   U
Stem-loop sequence CGUCUUUACAUUGAAUGGUUUGAUGUCUUGUUAAUCAUGACCUUAUAGAUAACCAACACUAAACAUUGGAUGGUUUGGUGUUUUGAUGAU